Plantago lagopus B Chromosome Is Enriched in 5S rDNA-Derived Satellite DNA
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F16%3A00460269" target="_blank" >RIV/60077344:_____/16:00460269 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1159/000444873" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1159/000444873</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1159/000444873" target="_blank" >10.1159/000444873</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Plantago lagopus B Chromosome Is Enriched in 5S rDNA-Derived Satellite DNA
Popis výsledku v původním jazyce
B chromosomes are supernumerary dispensable parts of the karyotype which appear in some individuals of some populations in some species. Using advanced sequencing technology, we in silico characterized the high-copy DNA composition of Plantago lagopus with and without B chromosomes. The nuclear genome (2.46 pg/2C) was found to be relatively rich in repetitive sequences, with highly and moderately repeated elements making up 68% of the genome. Besides a centromere-specific marker, we identified a B-specific satellite and a repeat enriched in polymorphic A chromosome segments. The B-specific tandem repeat PLsatB originated from sequence amplification including 5S rDNA fragments.
Název v anglickém jazyce
Plantago lagopus B Chromosome Is Enriched in 5S rDNA-Derived Satellite DNA
Popis výsledku anglicky
B chromosomes are supernumerary dispensable parts of the karyotype which appear in some individuals of some populations in some species. Using advanced sequencing technology, we in silico characterized the high-copy DNA composition of Plantago lagopus with and without B chromosomes. The nuclear genome (2.46 pg/2C) was found to be relatively rich in repetitive sequences, with highly and moderately repeated elements making up 68% of the genome. Besides a centromere-specific marker, we identified a B-specific satellite and a repeat enriched in polymorphic A chromosome segments. The B-specific tandem repeat PLsatB originated from sequence amplification including 5S rDNA fragments.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GBP501%2F12%2FG090" target="_blank" >GBP501/12/G090: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Cytogenetic and Genome Research
ISSN
1424-8581
e-ISSN
—
Svazek periodika
148
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
68-73
Kód UT WoS článku
000377998500009
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-84966948796