Molecular characterization and complete genome of a novel nepovirus from red clover

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F18%3A00492173" target="_blank" >RIV/60077344:_____/18:00492173 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00705-018-3742-9" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1007/s00705-018-3742-9</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00705-018-3742-9" target="_blank" >10.1007/s00705-018-3742-9</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Molecular characterization and complete genome of a novel nepovirus from red clover

Popis výsledku v původním jazyce

During high throughput sequencing (HTS) of leaves from a symptomatic red clover plant, a new RNA virus, tentatively named red clover nepovirus A (RCNVA), was discovered. The complete genomic sequence was determined and characterized. Particularly noteworthy was that RCNVA shares high sequence identities in RNA1 with a group of phylogenetically related nepoviruses while homologies in the RNA2 segments are markedly lower. Based on the genomic organization and phylogenetic attributes, RCNVA should be classified as a novel virus of the genus Nepovirus (subfamily Comovirinae, family Secoviridae, order Picornavirales).

Název v anglickém jazyce

Molecular characterization and complete genome of a novel nepovirus from red clover

Popis výsledku anglicky

During high throughput sequencing (HTS) of leaves from a symptomatic red clover plant, a new RNA virus, tentatively named red clover nepovirus A (RCNVA), was discovered. The complete genomic sequence was determined and characterized. Particularly noteworthy was that RCNVA shares high sequence identities in RNA1 with a group of phylogenetically related nepoviruses while homologies in the RNA2 segments are markedly lower. Based on the genomic organization and phylogenetic attributes, RCNVA should be classified as a novel virus of the genus Nepovirus (subfamily Comovirinae, family Secoviridae, order Picornavirales).

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

<a href="/cs/project/LD15035" target="_blank" >LD15035: Jak využívat a interpretovat přebytek dat z paralelního sekvenování v rostlinné virologii?</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Archives of Virology

ISSN

0304-8608

e-ISSN

—

Svazek periodika

163

Číslo periodika v rámci svazku

5

Stát vydavatele periodika

AT - Rakouská republika

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

1387-1389

Kód UT WoS článku

000429328300034

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85045022701