Complete genome sequences of novel Berlinvirus and novel Certrevirus lytic for Pectobacterium sp. causing soft rot and black leg disease of potato

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F21%3A00548331" target="_blank" >RIV/60077344:_____/21:00548331 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60109807:_____/21:N0000027 RIV/60461373:22330/21:43921976

Výsledek na webu

<a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s11262-021-01838-9" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007/s11262-021-01838-9</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s11262-021-01838-9" target="_blank" >10.1007/s11262-021-01838-9</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Complete genome sequences of novel Berlinvirus and novel Certrevirus lytic for Pectobacterium sp. causing soft rot and black leg disease of potato

Popis výsledku v původním jazyce

Two novel dsDNA bacteriophages named Pectobacterium virus CB251 (PcCB251) and Pectobacterium virus CB7V (PcCB7V) targeting plant pathogen Pectobacterium parmentieri have been isolated and sequenced. The PcCB251 genome consists of 40,557 bp with G+C content of 48.6% and contains 47 predicted genes on a single strand. The phage is classified in genus Berlinvirus, family Autographiviridae. The PcCB7V phage has a circular dsDNA genome of 146,054 bp with G+C content of 50.4% and contains 269 predicted protein genes on both strands and 13 tRNA genes. The PcCB7V phage can be classified in genus Certrevirus, subfamily Vequintavirinae. Both novel bacteriophages have narrow host ranges, but they extend the list of candidates for phage-based control of pectolytic bacteria causing soft rot disease of potato.

Název v anglickém jazyce

Complete genome sequences of novel Berlinvirus and novel Certrevirus lytic for Pectobacterium sp. causing soft rot and black leg disease of potato

Popis výsledku anglicky

Two novel dsDNA bacteriophages named Pectobacterium virus CB251 (PcCB251) and Pectobacterium virus CB7V (PcCB7V) targeting plant pathogen Pectobacterium parmentieri have been isolated and sequenced. The PcCB251 genome consists of 40,557 bp with G+C content of 48.6% and contains 47 predicted genes on a single strand. The phage is classified in genus Berlinvirus, family Autographiviridae. The PcCB7V phage has a circular dsDNA genome of 146,054 bp with G+C content of 50.4% and contains 269 predicted protein genes on both strands and 13 tRNA genes. The PcCB7V phage can be classified in genus Certrevirus, subfamily Vequintavirinae. Both novel bacteriophages have narrow host ranges, but they extend the list of candidates for phage-based control of pectolytic bacteria causing soft rot disease of potato.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910028" target="_blank" >QK1910028: Biologická ochrana brambor proti vybraným patogenním bakteriím</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Virus Genes

ISSN

0920-8569

e-ISSN

1572-994X

Svazek periodika

57

Číslo periodika v rámci svazku

3

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

302-305

Kód UT WoS článku

000645477900001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85105729444