Complete genome sequence of Xanthomonas phage M29, a new member of Foxunavirus isolated in the Czech Republic

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F23%3A00584339" target="_blank" >RIV/60077344:_____/23:00584339 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/62156489:43510/23:43923929

Výsledek na webu

<a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s11262-023-02027-6" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007/s11262-023-02027-6</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/s11262-023-02027-6" target="_blank" >10.1007/s11262-023-02027-6</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Complete genome sequence of Xanthomonas phage M29, a new member of Foxunavirus isolated in the Czech Republic

Popis výsledku v původním jazyce

The newly discovered Xanthomonas phage M29 (Xp M29) is the first lytic phage infecting Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) that was isolated from cabbage leaves in the Czech Republic. The phage consists of icosahedral head approximately 60 nm in diameter and a probably contractile tail of 170 nm. The complete genome size was 42 891 bp, with a G + C content of 59.6%, and 69 ORFs were predicted on both strands. Pairwise nucleotide comparison showed the highest similarity with the recently described Xanthomonas phage FoX3 (91.2%). Bacteriophage Xp M29 has a narrow host range infecting 5 out of 21 isolates of Xcc. Xp M29 is a novel species in a newly formed genus Foxunavirus assigned directly to the class Caudoviricetes.

Název v anglickém jazyce

Complete genome sequence of Xanthomonas phage M29, a new member of Foxunavirus isolated in the Czech Republic

Popis výsledku anglicky

The newly discovered Xanthomonas phage M29 (Xp M29) is the first lytic phage infecting Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) that was isolated from cabbage leaves in the Czech Republic. The phage consists of icosahedral head approximately 60 nm in diameter and a probably contractile tail of 170 nm. The complete genome size was 42 891 bp, with a G + C content of 59.6%, and 69 ORFs were predicted on both strands. Pairwise nucleotide comparison showed the highest similarity with the recently described Xanthomonas phage FoX3 (91.2%). Bacteriophage Xp M29 has a narrow host range infecting 5 out of 21 isolates of Xcc. Xp M29 is a novel species in a newly formed genus Foxunavirus assigned directly to the class Caudoviricetes.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

<a href="/cs/project/TP01010022" target="_blank" >TP01010022: Podpora ověření aplikačního potenciálu 2.0 na Biologickém centru AV ČR</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Virus Genes

ISSN

0920-8569

e-ISSN

1572-994X

Svazek periodika

59

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

874-877

Kód UT WoS článku

001061427200001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85169823614