Comprehensive analysis of silk proteins and gland compartments in Limnephilus lunatus, a case‑making trichopteran

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F24%3A00585827" target="_blank" >RIV/60077344:_____/24:00585827 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68378050:_____/24:00585827 RIV/60076658:12310/24:43908333

Výsledek na webu

<a href="https://bmcgenomics.biomedcentral.com/counter/pdf/10.1186/s12864-024-10381-4.pdf" target="_blank" >https://bmcgenomics.biomedcentral.com/counter/pdf/10.1186/s12864-024-10381-4.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1186/s12864-024-10381-4" target="_blank" >10.1186/s12864-024-10381-4</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Comprehensive analysis of silk proteins and gland compartments in Limnephilus lunatus, a case‑making trichopteran

Popis výsledku v původním jazyce

Caddisfly larvae produce silk containing heavy and light fibroins, similar to the silk of Lepidoptera, for the construction of underwater structures. We analyzed the silk of Limnephilus lunatus belonging to the case-forming suborder Integripalpia. We analyzed the transcriptome, mapped the transcripts to a reference genome and identified over 80 proteins using proteomic methods, and checked the specificity of their expression. For comparison, we also analyzed the transcriptome and silk proteome of Limnephilus flavicornis. Our results show that fibroins and adhesives are produced together in the middle and posterior parts of the silk glands, while the anterior part produces enzymes and an unknown protein AT24. The number of silk proteins of L. lunatus far exceeds that of the web-spinning Plectrocnemia conspersa, a previously described species from the suborder Annulipalpia. Our results support the idea of increasing the structural complexity of silk in rigid case builders compared to trap web builders.

Název v anglickém jazyce

Comprehensive analysis of silk proteins and gland compartments in Limnephilus lunatus, a case‑making trichopteran

Popis výsledku anglicky

Caddisfly larvae produce silk containing heavy and light fibroins, similar to the silk of Lepidoptera, for the construction of underwater structures. We analyzed the silk of Limnephilus lunatus belonging to the case-forming suborder Integripalpia. We analyzed the transcriptome, mapped the transcripts to a reference genome and identified over 80 proteins using proteomic methods, and checked the specificity of their expression. For comparison, we also analyzed the transcriptome and silk proteome of Limnephilus flavicornis. Our results show that fibroins and adhesives are produced together in the middle and posterior parts of the silk glands, while the anterior part produces enzymes and an unknown protein AT24. The number of silk proteins of L. lunatus far exceeds that of the web-spinning Plectrocnemia conspersa, a previously described species from the suborder Annulipalpia. Our results support the idea of increasing the structural complexity of silk in rigid case builders compared to trap web builders.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

BMC Genomics

ISSN

1471-2164

e-ISSN

1471-2164

Svazek periodika

25

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

16

Strana od-do

472

Kód UT WoS článku

001222751100009

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85193206681