Stanovení hlavních fylogenetických skupin bakterií v hyporheických sedimentech malého nížinného toku (Sitka, ČR) pomocí fluorescenční hybridizace in situ (FISH).

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077387%3A_____%2F03%3A62033026" target="_blank" >RIV/60077387:_____/03:62033026 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Stanovení hlavních fylogenetických skupin bakterií v hyporheických sedimentech malého nížinného toku (Sitka, ČR) pomocí fluorescenční hybridizace in situ (FISH).

Popis výsledku v původním jazyce

Struktura bakteriálního společenstva hyporheických sedimentů malého nížinného potoka (Sitka, ČR) byla analyzována pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH). FISH analýza umožnila identifikovat přibližně 91 % bakteriálních buněk obarvených specifickým barvivem DAPI. K identifikaci společenstva byly použity oligonukleotidové proby pro podskupiny ~.alpha.~-, ~.beta.~-, ~.gamma.~-Proteobacteria a Cytophaga-Flavobacterium skupiny Eubacteria. Mikrobiální komunitě dominovala skupina ~.beta.~-Proteobacteria - 36,3 % celkových počtů. Kromě domény Eubacteria se podařilo identifikovat také zástupce skupiny Archaebacteria (cca 6 % z celkové abundance bakterií).

Název v anglickém jazyce

Determination of the main phylogenetic groups of bacteria in the hyporheic sediments of the small lowland creek (Sitka, Czech Republic) using fluorescent in situ hybridization (FISH).

Popis výsledku anglicky

Community structure of biofilm microbial communities of hyporheic sediments in a small lowland stream Sitka (Czech Republic) was analysed using fluorescent in situ hybridization (FISH). FISH provided detection of about 91 % of total DAPI-stained bacterial cells. In general, most of the EUB338-detectable cells (domain Eubacteria) could be related to the four major phylogenetic groups used in this study (~.alpha.~-, ~.beta.~-, ~.gamma.~-Proteobacteria and Cytophaga-Flavobacterium). The microbial communitystructure of biofilm analysed was dominated by ~.beta.~-Proteobacteria (36,3 % of the total counts). Besides the domain Eubacteria the members of domain Archaebacteria were detected in hyporheic sediments (approximately 6 % of total bacterial counts).

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

DA - Hydrologie a limnologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Acta Facultatis Ecologiae

ISSN

1336-300X

e-ISSN

—

Svazek periodika

10

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

SK - Slovenská republika

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

35-37

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—