Specifická metoda RT-PCR pro virus klíšťové encefalitidy: rychlý test pro detekci patogena bez purifikace virové RNA
Popis výsledku
Klíšťová encefalitida působená virem klíšťové encefalitidy (KE) a lymeská borelióza působená spirochétami patří v ČR mezi nejdůležitější nemoci přenášené klíšťaty. Předkládáme efektivní a specifický test pro detekci viru KE v jednotlivých klíšťatech nebove skupině klíšťat založený na průkazu KE-virově specifické RNA s použitím techniky RT-PCR bez potřeby purifikovat RNA. Metoda je vysoce citlivá, s detekčním limitem okolo 14 fg KE-virové RNA v celkové RNA získané z mozkové suspenze z novorozených myšekinfikovaných virem KE. Primery byly odvozeny z 5´-nekódující oblasti virového genomu, která je vysoce konzervativní. Metoda byly úspěšně použita k identifikaci viru KE v klíšťatech z terénních sběrů. Metoda může být použita při studiu různých aspektů KE/viru KE: epidemilogie, mapování přírodních ohnisek nákazy KE, cirkulace a detekci KE-virově specifických sekvencí v klinických vzorcích
Klíčová slova
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12310/04:00008659
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Tick-borne encephalitis virus-specific RT-PCR - a rapid test for detection of the pathogen without viral RNA purification
Popis výsledku v původním jazyce
Among diseases transmitted by ticks in the Czech Republic, tick-borne encephalitis (TBE) caused by Tick-borne encephalitis virus (TBEV) and Lyme disease caused by Borrelia burgdorferi spirochete are most important. We propose an effective and specific test for detection of TBEV in a single tick or a pool of ticks based on the detection of TBEV RNA using an RT-PCR technique without RNA purification. The method is very sensitive with the detection limit of about 14 fg TBEV RNA in total RNA obtained from brain suspension from suckling mice infected with TBEV per reaction. The primers were derived from the 5'-terminal non-coding region, a highly conserved part of the virus. The method was successfully applied to field-collected ticks in detecting TBEV RNA.This method can be used in studies of several aspects of TBEV: epidemiology, screening of natural foci, circulation and detection of virus genome sequences in clinical materials
Název v anglickém jazyce
Tick-borne encephalitis virus-specific RT-PCR - a rapid test for detection of the pathogen without viral RNA purification
Popis výsledku anglicky
Among diseases transmitted by ticks in the Czech Republic, tick-borne encephalitis (TBE) caused by Tick-borne encephalitis virus (TBEV) and Lyme disease caused by Borrelia burgdorferi spirochete are most important. We propose an effective and specific test for detection of TBEV in a single tick or a pool of ticks based on the detection of TBEV RNA using an RT-PCR technique without RNA purification. The method is very sensitive with the detection limit of about 14 fg TBEV RNA in total RNA obtained from brain suspension from suckling mice infected with TBEV per reaction. The primers were derived from the 5'-terminal non-coding region, a highly conserved part of the virus. The method was successfully applied to field-collected ticks in detecting TBEV RNA.This method can be used in studies of several aspects of TBEV: epidemiology, screening of natural foci, circulation and detection of virus genome sequences in clinical materials
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
GA524/03/1326: Molekulární identifikace a genetická charakterizace spirochét Lymeské boreliózy
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2004
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Acta Virologica
ISSN
0001-723X
e-ISSN
—
Svazek periodika
48
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
167-171
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—
Základní informace
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
Rok uplatnění
2004