Detekce Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus v rostlinách bramboru pomocí duplex Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F16%3AN0000005" target="_blank" >RIV/60109807:_____/16:N0000005 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Detekce Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus v rostlinách bramboru pomocí duplex Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami
Popis výsledku v původním jazyce
Bakterie Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Cms), způsobující bakteriální kroužkovitost bramboru, patří dle směrnice EPPO mezi regulované (karanténní) A2 škodlivé organismy. Detektabilita Cms v rostlinách bramboru může být ovlivněna koncentrací a migrací bakterie v pletivech a případnou inhibicí PCR. Cms může vyvolávat bezpříznakové infekce a tím snadno unikat pozornosti. Cílem práce bylo ověření a inovace detekce Cms v pletivech bramboru pomocí Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami v duplexu s interní kontrolou. Použitý modifikovaný extrakční postup byl vhodný pro izolaci kvalitní DNA z hlíz nebo stonků bramboru. Výsledky PCR analýz ukázaly vysokou specifičnost a spolehlivost metody. Pomocí interní kontroly byla snadná kontrola kvality DNA a inhibice PCR reakce. Duplex Real-Time PCR s TaqMan-MGB sondami představuje metodu pro rychlou a citlivou detekci Cms v hlízách a stoncích bramboru.
Název v anglickém jazyce
Detection of Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus in potato plants by Duplex Real-Time PCR with TaqMan-MGB probes
Popis výsledku anglicky
Bacteria Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus (Cms), causing potato ring rot, includes according to directive EPPO between regulated (quarantine) pests A2. Cms detectability in potato plants may be influenced by concentration and migration of bacteria in the tissue and the possible inhibition of PCR. Cms can cause asymptomatic infection and therefore easily overlooked. The aim was to verify and innovation the detection of bacteria by Duplex Real-Time PCR with TaqMan-MGB probes in the tissues of potato. Using modified extraction procedure was suitable for quality DNA isolation from tubers or stems of potato. The results of the PCR analysis showed a high specificity and reliability of the method. Using internal controls were easy quality control of DNA and PCR inhibition. Duplex Real-time PCR with TaqMan-MGB probes represents a method for rapid and sensitive Cms detection in tubers and stems of potato.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Svazek periodika
LXIV
Číslo periodika v rámci svazku
12
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
229-232
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—