Metodika diagnostiky Helminthosporium solani v hlízách bramboru pomocí real-time PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F23%3AN0000055" target="_blank" >RIV/60109807:_____/23:N0000055 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/62156489:43210/23:43924872

Výsledek na webu

<a href="https://www.vubhb.cz/cs/knihovna/certifikovane-metodiky" target="_blank" >https://www.vubhb.cz/cs/knihovna/certifikovane-metodiky</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metodika diagnostiky Helminthosporium solani v hlízách bramboru pomocí real-time PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem certifikované metodiky je optimalizace molekulárních metod diagnostiky Helminthosporium solani Durieu & Mont., (1849), původce stříbřitosti slupky, v posledních letech důležité skládkové choroby bramboru (Solanum tuberosum L.), která snižuje především tržní hodnotu hlíz. Použité metody založené na PCR, tj. TaqMan real-time PCR a SybrGreen real-time PCR, zvýší citlivost detekce H. solani v hlízách bramboru, zajistí vyšší spolehlivost a rychlost diagnostiky. Protokoly budou optimalizovány pro použití v běžné diagnostické laboratoři vybavené zařízením pro molekulární biologii.

Název v anglickém jazyce

Methodology for diagnosing Helminthosporium solani in potato tubers using real-time PCR

Popis výsledku anglicky

The aim of the certified methodology is to optimize the molecular methods of diagnosis of Helminthosporium solani Durieu & Mont., (1849), the causative agent of silvery skin, an important landfill disease of potatoes (Solanum tuberosum L.) in recent years, which primarily reduces the market value of tubers. The PCR-based methods used, i.e. TaqMan real-time PCR and SybrGreen real-time PCR, will increase the sensitivity of detection of H. solani in potato tubers, ensure higher reliability and speed of diagnosis. The protocols will be optimized for use in a routine diagnostic laboratory equipped with molecular biology equipment.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

<a href="/cs/project/QK21010083" target="_blank" >QK21010083: Ekologická ochrana konzumních brambor jako zdravé zeleniny proti vybraným půdou a sadbou přenášeným patogenům</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

praktické informace č. 90

Číslo předpisu

UKZUZ 213609/2023

Technické parametry

Byla uzavřena smlouva o implementaci metodiky se společností Vesa Velhartice, a.s.

Ekonomické parametry

Zavedení metodiky do laboratorní praxe (laboratoře přístrojově vybavené na molekulární metody) vyžaduje tyto náklady: Pro detekci H.solani je nezbytné pořízení speciálního přístrojového vybavení jako je termocykler pro real-time PCR (300–500 tis. Kč). Cena za extrakci DNA z jednoho vzorku pletiva bramboru potřebné pro real-time PCR je 50–150 Kč (dle zvolené extrakční sady). Vlastní náklady na detekci H. solani pomocí real-time PCR jsou 100–140 Kč (TaqMan, jeden test; dle zvolené reakční sady) nebo 20–50 Kč (Sybr Green; jeden test; dle zvolené reakční sady). Ceny jsou kalkulovány na základě nejlevnější nabídky spotřebního materiálu, nezahrnují režie v a jsou bez DPH. Metoda Sybr Green real-time PCR je v současnosti levnější z důvodu absence sondy, kterou vyžaduje TaqMan real-time PCR. Konvenční PCR je cenově srovnatelná s metodou Sybr Green real-time PCR. Vyžaduje však analýzu konečného produktu pomocí gelové elektroforézy.

Označení certifikačního orgánu

ÚKZÚZ

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů