Metodika kvantifikace houbového patogenu Rhizoctonia solani v půdě metodou real-time PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F24%3AN0000039" target="_blank" >RIV/60109807:_____/24:N0000039 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/62156489:43210/24:43924786

Výsledek na webu

<a href="http://www.mendelu.cz" target="_blank" >http://www.mendelu.cz</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metodika kvantifikace houbového patogenu Rhizoctonia solani v půdě metodou real-time PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem certifikované metodiky je optimalizovat molekulární metody detekce a kvantifikace polyfágního houbového patogenu Rhizoctonia solani z půdního prostředí. Metodika je zaměřena na hostitele lilek brambor, u kterého tento patogen způsobuje významné onemocnění – vločkovitost hlíz bramboru. Použitá metoda SybrGreen real-time PCR umožňuje vysokou citlivost detekce uvedeného patogenu v půdě a zajišťuje spolehlivost diagnostiky. Protokoly jsou optimalizovány pro běžné použití v laboratořích zabývajících se molekulární biologií.

Název v anglickém jazyce

Methodology for quantification of the fungal pathogen Rhizoctonia solani in soil using real-time PCR

Popis výsledku anglicky

The aim of the certified methodology is to optimize molecular methods for the detection and quantification of the polyphagous fungal pathogen Rhizoctonia solani from the soil environment. The methodology is focused on the host potato blight, in which this pathogen causes a significant disease – potato tuber flaking. The SybrGreen real-time PCR method used allows for high sensitivity of the detection of the pathogen in the soil and ensures the reliability of diagnostics. The protocols are optimized for routine use in molecular biology laboratories.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

<a href="/cs/project/QK21010083" target="_blank" >QK21010083: Ekologická ochrana konzumních brambor jako zdravé zeleniny proti vybraným půdou a sadbou přenášeným patogenům</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

certifikovaná metodika

Číslo předpisu

UKZUZ 017154/2024

Technické parametry

Byla uzavřena smlouva o implementaci metodiky se společností Vesa Velhartice, a.s.

Ekonomické parametry

Zavedení metodiky do laboratorní praxe (laboratoře přístrojově vybavené na molekulární metody) vyžaduje tyto náklady: Pro detekci R. solani je nezbytné pořízení speciálního přístroje – termocykleru pro real-time PCR (400–900 tis. Kč) Cena za extrakci DNA z jednoho vzorku půdy, myceliární kultury či rostlinného pletiva (referenční DNA) potřebné pro real-time PCR je 260 Kč (při doporučeném izolačním kitu). Vlastní náklady na detekci R. solani pomocí real-time PCR je 96 Kč (při doporučeném reakčním kitu). Cena jednoho kompletního testu (1 vzorek ve 3 technických opakováních; testovaný gen a referenční gen) se pohybuje kolem 360 Kč. Ceny jsou kalkulovány na základě nejlevnější nabídky spotřebního materiálu, nezahrnují režie a jsou bez DPH. Metoda Sybr Green real-time PCR je v současnosti levnější z důvodu absence sondy, kterou vyžaduje TaqMan real-time PCR.

Označení certifikačního orgánu

ÚKZÚZ

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů