Metodika detekce Y viru bramboru (Potato virus Y) v listech a hlízách pomocí metod založených na PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F20%3AN0000023" target="_blank" >RIV/60109807:_____/20:N0000023 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.vubhb.cz" target="_blank" >http://www.vubhb.cz</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metodika detekce Y viru bramboru (Potato virus Y) v listech a hlízách pomocí metod založených na PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem certifikované metodiky bylo optimalizovat molekulárně-biologické laboratorní metody detekce a determinace hospodářsky nejvýznamnějšího viru lilku bramboru (Solanum tuberosum L.), tj. Y viru bramboru (Potato virus Y – PVY). Použité metody založené na PCR (TaqMan real-time RT-PCR a SybrGreen real-time RT-PCR) zvýší citlivost detekce PVY v listech a hlízách bramboru, zajistí vyšší spolehlivost diagnostiky a významně urychlí výsledky. Protokoly byly optimalizovány pro použití v běžné diagnostické laboratoři vybavené zařízením pro molekulární biologii. V metodice jsou uvedeny podrobné ověřené a optimalizované laboratorní manuály postupů rutinní detekce PVY v pletivech bramboru pomocí exaktních metod na molekulární úrovni, které zahrnují odběr vzorků, izolaci RNA, vlastní postup přípravy reakcí, kontrolu specificity a vyhodnocení výsledků. Kvalitu extrahované RNA a vznik možných falešně negativních výsledků lze snadno kontrolovat pomocí interního standardu zařazeného do testů. Certifikovaná metodika je určená pro pracoviště, která se zabývají diagnostikou patogenů rostlin, především pro šlechtitelské organizace, výzkumné ústavy, diagnostické laboratoře státní správy a případně zemědělskou praxi. Včasná a citlivá detekce PVY pomocí metod založených na PCR ve výchozích šlechtitelských materiálech bramboru přispěje k eliminaci infekce zamezením dalšího přenosu a tím ke snížení ekonomických ztrát dané šlechtitelské organizace. Zdravý sadbový materiál patří k nejdůležitějším způsobům eliminace virů.

Název v anglickém jazyce

Methodology for detection of Potato virus Y in leaves and tubers using PCR-based methods

Popis výsledku anglicky

The aim of the certified methodology was to optimize molecular-biological laboratory methods for the detection and determination of the most economically important potato virus (Solanum tuberosum L.), ie potato virus Y (PVY). The PCR-based methods used (TaqMan real-time RT-PCR and SybrGreen real-time RT-PCR) will increase the sensitivity of PVY detection in potato leaves and tubers, ensure higher diagnostic reliability and significantly speed up results. The protocols have been optimized for use in a routine diagnostic laboratory equipped with molecular biology equipment.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

praktické informace č. 82

Číslo předpisu

UKZUZ 224027/2020

Technické parametry

Byla uzavřena smlouva o implementaci metodiky se společností Vesa Velhartice a.s.

Ekonomické parametry

Používání zdravé sadby je jedním z významných faktorů pro zvýšení produkce. Infekce pocházející z infikovaných sadbových hlíz (sekundární infekce) způsobuje nejvýznamnější snížení výnosů. Při napadení rostlin PVY dochází k 10 až 80% redukci výnosu hlíz, která může být zesílena v kombinaci s dalšími druhy virů. Při snížení výnosu konzumních brambor jenom o 10 % by vznikla zemědělským podnikům při současných průměrných cenách ekonomická ztráta 20–40 tis. Kč na hektar. Při snížení výnosu sadbových hlíz o 10 % vznikne ekonomická ztráta cca 20 tis. Kč na hektar. Vysoká infekce PVY vede dále k „sestupnění“ nebo zamítnutí sadbových materiálů, což znamená další významné ekonomické ztráty pro zemědělské podniky zaměřené na produkci sadby. Zdravý sadbový materiál patří k nejdůležitějším způsobům eliminace virů.

Označení certifikačního orgánu

ÚKZÚZ

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů