Evaluation of plastid DNA non-coding regions diversity in selected species of genus solanum.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60109807%3A_____%2F17%3AN0000023" target="_blank" >RIV/60109807:_____/17:N0000023 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.agriculturejournals.cz/web/cjgpb.htm?type=article&id=76_2015-CJGPB" target="_blank" >http://www.agriculturejournals.cz/web/cjgpb.htm?type=article&id=76_2015-CJGPB</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.17221/76/2015-CJGPB" target="_blank" >10.17221/76/2015-CJGPB</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Evaluation of plastid DNA non-coding regions diversity in selected species of genus solanum.
Popis výsledku v původním jazyce
The diversity of three non-coding plastid DNA loci (spacer trnL/trnF, spacer trnV/16SrRNA, intron trnL/trnL) was assessed in 16 Solanum L. species (135 individuals). Polymorphisms were detected on a principle of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and verified by direct sequencing. None intra-specific diversity and only poor inter-specific diversity was detected. Unique S. mochiquense Ochoa specific length polymorphism in trnL/trnL represented by duplication of an 18 bp segment was discovered. Detected DGGE inter-specific trnL/trnF polymorphism did not associate specifically with really confirmed single point mutations in sequence. DGGE method was found as a simple and cheap pre-exploring tool for mutations detection in compared DNA regions and some identified polymorphisms can be used in management of genetic resources.
Název v anglickém jazyce
Evaluation of plastid DNA non-coding regions diversity in selected species of genus solanum.
Popis výsledku anglicky
The diversity of three non-coding plastid DNA loci (spacer trnL/trnF, spacer trnV/16SrRNA, intron trnL/trnL) was assessed in 16 Solanum L. species (135 individuals). Polymorphisms were detected on a principle of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and verified by direct sequencing. None intra-specific diversity and only poor inter-specific diversity was detected. Unique S. mochiquense Ochoa specific length polymorphism in trnL/trnL represented by duplication of an 18 bp segment was discovered. Detected DGGE inter-specific trnL/trnF polymorphism did not associate specifically with really confirmed single point mutations in sequence. DGGE method was found as a simple and cheap pre-exploring tool for mutations detection in compared DNA regions and some identified polymorphisms can be used in management of genetic resources.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QJ1210305" target="_blank" >QJ1210305: Integrovaná ochrana proti plísni bramboru v nových agroenvironmentálních podmínkách s využitím prognózy výskytu choroby a na základě nových poznatků o změnách v populacich patogena a procesech rozkladu hlíz</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Czech Journal of Genetics and Plant Breeding
ISSN
1212-1975
e-ISSN
1805-9325
Svazek periodika
53
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
127-131
Kód UT WoS článku
000410679800006
EID výsledku v databázi Scopus
—