Identifikace faktorů pathogenicity fytoparasitických nematod Ditylenchus dipsaci pomocí cDNA-AFLP strategie

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41210%2F05%3A11446" target="_blank" >RIV/60460709:41210/05:11446 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

An Efficent CDNA-AFLP ? Based Strategy for the Identification of Pathogenity Factors from the stem Nematode Ditylenchus dipsaci,

Popis výsledku v původním jazyce

Ditylenchus dipsaci, the stem nematode , is a migratory endoparasite of over 500 species of angiosperms. Biological responses and developmental processes are precisely controlled at the level of gene expression. Most pathogenicity factors are not expresse consitutively, but in highly coordinated way. A relatively simple method for profiling differential gene expression is cDNA-amplified fragment lenght polymorphism (cDNA-AFLP). We aimed to used the cDNA-AFLP technique to sample the D. dipsaci transcriptome and discovere genes specifically up-regulated during host infection. A random sample of six TDFs representating gene transcripts more abundant or specifically PCR amplified from infested plant tissues cDNAs, but not from non-infested plant material and nematode suspension cDNAs were cloned and sequenced after PCR re-amplification. Each sequence was compared by the BLASTX algorithm to sequences within the GenBank database. Besides similarities with Caenorhabditis elegans proteins, one

Název v anglickém jazyce

An Efficent CDNA-AFLP ? Based Strategy for the Identification of Pathogenity Factors from the stem Nematode Ditylenchus dipsaci,

Popis výsledku anglicky

Ditylenchus dipsaci, the stem nematode , is a migratory endoparasite of over 500 species of angiosperms. Biological responses and developmental processes are precisely controlled at the level of gene expression. Most pathogenicity factors are not expresse consitutively, but in highly coordinated way. A relatively simple method for profiling differential gene expression is cDNA-amplified fragment lenght polymorphism (cDNA-AFLP). We aimed to used the cDNA-AFLP technique to sample the D. dipsaci transcriptome and discovere genes specifically up-regulated during host infection. A random sample of six TDFs representating gene transcripts more abundant or specifically PCR amplified from infested plant tissues cDNAs, but not from non-infested plant material and nematode suspension cDNAs were cloned and sequenced after PCR re-amplification. Each sequence was compared by the BLASTX algorithm to sequences within the GenBank database. Besides similarities with Caenorhabditis elegans proteins, one

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Sborník abstraktů z konference posluchačů postgraduálního doktorského studia MendelNet 05 Agro, Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně

ISBN

80-7157-905-X

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

33-33

Název nakladatele

Mendelova zemědělská a lesnická univerzita v Brně, Zemědělská 1, 613 00 Brno,

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

29. 11. 2005

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—