Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Five novel bifidobacterial species isolated from faeces of primates in two Czech zoos: Bifidobacterium erythrocebi sp. nov., Bifidobacterium moraviense sp. nov., Bifidobacterium oedipodis sp. nov., Bifidobacterium olomucense sp. nov. and Bifidobacterium panos sp. nov

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41210%2F20%3AN0000108" target="_blank" >RIV/60460709:41210/20:N0000108 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60460709:41210/21:83505

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004573" target="_blank" >https://doi.org/10.1099/ijsem.0.004573</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.004573" target="_blank" >10.1099/ijsem.0.004573</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Five novel bifidobacterial species isolated from faeces of primates in two Czech zoos: Bifidobacterium erythrocebi sp. nov., Bifidobacterium moraviense sp. nov., Bifidobacterium oedipodis sp. nov., Bifidobacterium olomucense sp. nov. and Bifidobacterium panos sp. nov

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Five Bifidobacterium strains, VB23T, VB24T, VB25T, VB26T and VB31T, were isolated from chimpanzee (Pan troglodytes), cotton-top tamarin (Saguinus oedipus), Goeldis marmoset (Callimico goeldii), moustached tamarin (Saguinus mystax) and patas monkey (Erythrocebus patas), respectively, which were kept in two Czech zoos. These strains were isolated from faecal samples and were Gram-positive, non-motile, non-sporulating, anaerobic and fructose-6-phosphate phosphoketolase-positive. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA revealed close relatedness between VB23T and Bifidobacterium angulatum LMG 11039T, VB24T and Bifidobacterium pullorum subsp. pullorum DSM 20433T, VB25T and Bifidobacterium goeldii LMG 30939T, VB26T and Bifidobacterium imperatoris LMG 30297T, and VB31T and B . angulatum LMG 11039T. Internal transcribed spacer profiling revealed that VB23T, VB24T, VB25T, VB26T and VB31T had highest similarity to Bifidobacterium breve LMG 13208T, Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697T, Bifidobacterium biavatii DSM 23969T, B. breve LMG 13208T and B. angulatum LMG 11039T, respectively. Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) analyses with their closest neighbours supported the independent phylogenetic positions of the strains with values. These genomic and phylogenetic analyses suggested that the evaluated strains were novel Bifidobacterium species named Bifidobacterium erythrocebi sp. nov. VB31T=DSM 109960T=CCUG 73843T, Bifidobacterium moraviense sp. nov. VB25T=DSM 109958T=CCUG 73842T, Bifidobacterium oedipodis sp. nov. VB24T=DSM 109957T=CCUG 73932T, Bifidobacterium olomucense sp. nov. VB26T=DSM 109959T=CCUG 73845T and Bifidobacterium panos sp. nov. VB23T=DSM 109963T=CCUG 73840T.

  • Název v anglickém jazyce

    Five novel bifidobacterial species isolated from faeces of primates in two Czech zoos: Bifidobacterium erythrocebi sp. nov., Bifidobacterium moraviense sp. nov., Bifidobacterium oedipodis sp. nov., Bifidobacterium olomucense sp. nov. and Bifidobacterium panos sp. nov

  • Popis výsledku anglicky

    Five Bifidobacterium strains, VB23T, VB24T, VB25T, VB26T and VB31T, were isolated from chimpanzee (Pan troglodytes), cotton-top tamarin (Saguinus oedipus), Goeldis marmoset (Callimico goeldii), moustached tamarin (Saguinus mystax) and patas monkey (Erythrocebus patas), respectively, which were kept in two Czech zoos. These strains were isolated from faecal samples and were Gram-positive, non-motile, non-sporulating, anaerobic and fructose-6-phosphate phosphoketolase-positive. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA revealed close relatedness between VB23T and Bifidobacterium angulatum LMG 11039T, VB24T and Bifidobacterium pullorum subsp. pullorum DSM 20433T, VB25T and Bifidobacterium goeldii LMG 30939T, VB26T and Bifidobacterium imperatoris LMG 30297T, and VB31T and B . angulatum LMG 11039T. Internal transcribed spacer profiling revealed that VB23T, VB24T, VB25T, VB26T and VB31T had highest similarity to Bifidobacterium breve LMG 13208T, Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697T, Bifidobacterium biavatii DSM 23969T, B. breve LMG 13208T and B. angulatum LMG 11039T, respectively. Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) analyses with their closest neighbours supported the independent phylogenetic positions of the strains with values. These genomic and phylogenetic analyses suggested that the evaluated strains were novel Bifidobacterium species named Bifidobacterium erythrocebi sp. nov. VB31T=DSM 109960T=CCUG 73843T, Bifidobacterium moraviense sp. nov. VB25T=DSM 109958T=CCUG 73842T, Bifidobacterium oedipodis sp. nov. VB24T=DSM 109957T=CCUG 73932T, Bifidobacterium olomucense sp. nov. VB26T=DSM 109959T=CCUG 73845T and Bifidobacterium panos sp. nov. VB23T=DSM 109963T=CCUG 73840T.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_019%2F0000845" target="_blank" >EF16_019/0000845: Centrum pro studium vzniku a transformací nutričně významných látek v potravním řetězci v interakci s potenciálně rizikovými látkami antropogenního původu: komplexní posouzení rizika kontaminace půdy pro kvalitu zemědělské produkce</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology

  • ISSN

    1466-5026

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    71

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    1-12

  • Kód UT WoS článku

    000636433500012

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85099963601