Reference Gene Selection for Normalizing Gene Expression in Ips Sexdentatus (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) Under Different Experimental Conditions

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41210%2F21%3A88335" target="_blank" >RIV/60460709:41210/21:88335 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60460709:41320/21:88335

Výsledek na webu

<a href="https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphys.2021.752768/full" target="_blank" >https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fphys.2021.752768/full</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.3389/fphys.2021.752768" target="_blank" >10.3389/fphys.2021.752768</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Reference Gene Selection for Normalizing Gene Expression in Ips Sexdentatus (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) Under Different Experimental Conditions

Popis výsledku v původním jazyce

Ips sexdentatus is one of the most destructive and economically important forest pests. A better understanding of molecular mechanisms underlying its adaptation to toxic host compounds may unleash the potential for future management of this pest. A suitable reference gene selection is fundamental for quantitative gene expression analysis and functional genomics studies in I. sexdentatus. Twelve commonly used reference genes in Coleopterans were screened under different experimental conditions to obtain accurate and reliable normalization of gene expression data. The findings were validated further using real-time quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR)-based target gene expression analysis. Nevertheless, the present study delivers a catalog of reference genes under varied experimental conditions for the coleopteran forest pest I. sexdentatus and paves the way for future gene expression and functional genomic studies on this species.

Název v anglickém jazyce

Reference Gene Selection for Normalizing Gene Expression in Ips Sexdentatus (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae) Under Different Experimental Conditions

Popis výsledku anglicky

Ips sexdentatus is one of the most destructive and economically important forest pests. A better understanding of molecular mechanisms underlying its adaptation to toxic host compounds may unleash the potential for future management of this pest. A suitable reference gene selection is fundamental for quantitative gene expression analysis and functional genomics studies in I. sexdentatus. Twelve commonly used reference genes in Coleopterans were screened under different experimental conditions to obtain accurate and reliable normalization of gene expression data. The findings were validated further using real-time quantitative reverse transcription PCR (RT-qPCR)-based target gene expression analysis. Nevertheless, the present study delivers a catalog of reference genes under varied experimental conditions for the coleopteran forest pest I. sexdentatus and paves the way for future gene expression and functional genomic studies on this species.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

40102 - Forestry

Projekt

<a href="/cs/project/EF15_003%2F0000433" target="_blank" >EF15_003/0000433: Vybudování excelentního vědeckého týmu na FLD ČZU v Praze a jeho přístrojově-technického zázemí zaměřeného na mitigaci důsledků klimatických změn v lesích (od úrovně genů po úroveň krajiny)</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Frontiers in Physiology

ISSN

1664-042X

e-ISSN

—

Svazek periodika

12

Číslo periodika v rámci svazku

October

Stát vydavatele periodika

CH - Švýcarská konfederace

Počet stran výsledku

18

Strana od-do

1-18

Kód UT WoS článku

000717675500001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85118711806