Effect of clonal testing on the efficiency of genomic evaluation in forest tree breeding

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41320%2F22%3A92971" target="_blank" >RIV/60460709:41320/22:92971 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.nature.com/articles/s41598-022-06952-8" target="_blank" >https://www.nature.com/articles/s41598-022-06952-8</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41598-022-06952-8" target="_blank" >10.1038/s41598-022-06952-8</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Effect of clonal testing on the efficiency of genomic evaluation in forest tree breeding

Popis výsledku v původním jazyce

Through stochastic simulations, accuracies of breeding values and response to selection were assessed under traditional pedigree-(BLUP) and genomic-based evaluation methods (GBLUP) in forest tree breeding. The latter provides a methodological foundation for genomic selection. We evaluated the impact of clonal replication in progeny testing on the response to selection realized in seed orchards under variable marker density and target effective population sizes. We found that clonal replication in progeny trials boosted selection accuracy, thus providing additional genetic gains under BLUP. While a similar trend was observed for GBLUP, however, the added gains did not surpass those under BLUP. Therefore, breeding programs deploying extensive progeny testing with clonal propagation might not benefit from the deployment of genomic information. These findings could be helpful in the context of operational breeding programs.

Název v anglickém jazyce

Effect of clonal testing on the efficiency of genomic evaluation in forest tree breeding

Popis výsledku anglicky

Through stochastic simulations, accuracies of breeding values and response to selection were assessed under traditional pedigree-(BLUP) and genomic-based evaluation methods (GBLUP) in forest tree breeding. The latter provides a methodological foundation for genomic selection. We evaluated the impact of clonal replication in progeny testing on the response to selection realized in seed orchards under variable marker density and target effective population sizes. We found that clonal replication in progeny trials boosted selection accuracy, thus providing additional genetic gains under BLUP. While a similar trend was observed for GBLUP, however, the added gains did not surpass those under BLUP. Therefore, breeding programs deploying extensive progeny testing with clonal propagation might not benefit from the deployment of genomic information. These findings could be helpful in the context of operational breeding programs.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

40102 - Forestry

Projekt

<a href="/cs/project/EF15_003%2F0000433" target="_blank" >EF15_003/0000433: Vybudování excelentního vědeckého týmu na FLD ČZU v Praze a jeho přístrojově-technického zázemí zaměřeného na mitigaci důsledků klimatických změn v lesích (od úrovně genů po úroveň krajiny)</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Scientific Reports

ISSN

2045-2322

e-ISSN

—

Svazek periodika

12

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

1-5

Kód UT WoS článku

000759999200035

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85125157135