ITS regions in molecular studies of genetic resources of yacon
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60460709%3A41610%2F12%3A55119" target="_blank" >RIV/60460709:41610/12:55119 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
slovinština
Název v původním jazyce
ITS úseky v molekulárnom hodnotení genetických zdrojov jakonu
Popis výsledku v původním jazyce
ITS úseky predstavujú zdroj variability rDNA oblastí využiteľný v hodnotení genetických zdrojov jakonu ako molekulárne markéry fylogenetických vzťahov. V práci bol vypracovaný protokol pre PCR identifikáciu úsekov medzi veľkou a malou podjednotkou rRNA pre následnú sekvenáciu pri trojici Bolívijských krajových odrôd jakonu (Smallanthus sonchifolius, Poepp. and Endl.). Identifikované úseky boli následne sekvenované a porovnané so sekvenciami ITS v databázach. Analyzované ITS úseky Bolívijských genotypovjakonu vykazujú variabilitu v pozícii nukleotidov 163-164 a 235-236 v porovnaní so sekvenciou ITS v databáze. ITS oblasti tak potvrdzujú svoju využiteľnosť v efektívnych analýzach genómu jakonu.
Název v anglickém jazyce
ITS regions in molecular studies of genetic resources of yacon
Popis výsledku anglicky
The internal transcribed spacer (ITS) region of ribosomal DNA (rDNA) has proven to be a useful tool for phylogenetic studies in many angiosperm families. For this reason we have decided to use ITS regions as molecular markers for the evaluation of phylogenetic relationships in yacon (Smallanthus sonchifolius, Poepp. and Endl.). The aim of our work was the optimization of a PCR protocol for the amplification of the region between the DNA coding the large and the small RNA subunit, and the comparison of sequences obtained. Amplicons obtained from three Bolivian yacon landraces were sequenced. Sequences obtained were alligned with ITS region present in the database. The analysed ITS regions of Bolivian yacon genotypes showed differences in the nucleotides163-164 and 235-236. ITS region has confirmed their potential in the effective yacon genome analyses.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Úroda
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Svazek periodika
9
Číslo periodika v rámci svazku
9
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
145-149
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—