Multiscale modelling of DNA mechanics

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22310%2F15%3A43900545" target="_blank" >RIV/60461373:22310/15:43900545 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/61388963:_____/15:00446777 RIV/00216208:11310/15:10315645

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/27/32/323102" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/27/32/323102</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1088/0953-8984/27/32/323102" target="_blank" >10.1088/0953-8984/27/32/323102</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Multiscale modelling of DNA mechanics

Popis výsledku v původním jazyce

Mechanical properties of DNA are important not only in a wide range of biological processes but also in the emerging field of DNA nanotechnology. We review some of the recent developments in modeling these properties, emphasizing the multiscale nature of the problem. Modern atomic resolution, explicit solvent molecular dynamics simulations have contributed to our understanding of DNA fine structure and conformational polymorphism. These simulations may serve as data sources to parameterize rigid base models which themselves have undergone major development. A consistent buildup of larger entities involving multiple rigid bases enables us to describe DNA at more global scales. Free energy methods to impose large strains on DNA, as well as bead models and other approaches, are also briefly discussed.

Název v anglickém jazyce

Multiscale modelling of DNA mechanics

Popis výsledku anglicky

Mechanical properties of DNA are important not only in a wide range of biological processes but also in the emerging field of DNA nanotechnology. We review some of the recent developments in modeling these properties, emphasizing the multiscale nature of the problem. Modern atomic resolution, explicit solvent molecular dynamics simulations have contributed to our understanding of DNA fine structure and conformational polymorphism. These simulations may serve as data sources to parameterize rigid base models which themselves have undergone major development. A consistent buildup of larger entities involving multiple rigid bases enables us to describe DNA at more global scales. Free energy methods to impose large strains on DNA, as well as bead models and other approaches, are also briefly discussed.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA14-21893S" target="_blank" >GA14-21893S: Nanomechanika strukturních motivů RNA a DNA</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

JOURNAL OF PHYSICS-CONDENSED MATTER

ISSN

0953-8984

e-ISSN

—

Svazek periodika

27

Číslo periodika v rámci svazku

22

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

323102

Kód UT WoS článku

000358596400002

EID výsledku v databázi Scopus

—