Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Homology Modelling and Molecular Dynamics Simulation of Beta-Galactosidase from Antarctic Bacterium Arthrobacter sp. C2-2 - sborník

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F03%3A00008977" target="_blank" >RIV/60461373:22330/03:00008977 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Homology Modelling and Molecular Dynamics Simulation of Beta-Galactosidase from Antarctic Bacterium Arthrobacter sp. C2-2 - sborník

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Enzymes from cold adapted organisms are gaining interest as catalysts in biotechnology. b­Galactosidase from Antarctic bacterium Arthrobacter sp. C2 ­2 was used as a model enzyme to study the structural b asis of adaptation to function at low temperature. Since the experimental structure is not yet known we used methodology of homology modelling and molecular dynamics simulation. Model was built by the method of homology modelling by satisfaction of spatial restraints. b­Galactosidase from E.coli (PDB identifier 1DP0) and human b­glucuronidase (PDB identifier 1BHG) were used as templates. To evaluate and optimize the model, homology modelling procedure was followed by simulation of 1 ns molecular dynamics. Presented work describes results of moleculardynamics simulation and their implication for understanding of mechanism of adaptation . Predicted structure of the enzyme is compared with its mesophilic counterpart and roles of electrostatic and hydrophobic interactions in adaptation ar

  • Název v anglickém jazyce

    Homology Modelling and Molecular Dynamics Simulation of Beta-Galactosidase from Antarctic Bacterium Arthrobacter sp. C2-2 - sborník

  • Popis výsledku anglicky

    Enzymes from cold adapted organisms are gaining interest as catalysts in biotechnology. b­Galactosidase from Antarctic bacterium Arthrobacter sp. C2 ­2 was used as a model enzyme to study the structural b asis of adaptation to function at low temperature. Since the experimental structure is not yet known we used methodology of homology modelling and molecular dynamics simulation. Model was built by the method of homology modelling by satisfaction of spatial restraints. b­Galactosidase from E.coli (PDB identifier 1DP0) and human b­glucuronidase (PDB identifier 1BHG) were used as templates. To evaluate and optimize the model, homology modelling procedure was followed by simulation of 1 ns molecular dynamics. Presented work describes results of moleculardynamics simulation and their implication for understanding of mechanism of adaptation . Predicted structure of the enzyme is compared with its mesophilic counterpart and roles of electrostatic and hydrophobic interactions in adaptation ar

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    CE - Biochemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA204%2F02%2F0843" target="_blank" >GA204/02/0843: Komplexní studium chladového přizpůsobení enzymů na molekulární úrovni a jejich uplatnění v biotechnologických procesech</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2003

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    Molecular & Cellular Proteomics

  • ISBN

    1535-9476

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    1

  • Strana od-do

    763

  • Název nakladatele

    American Society for Biochemistry and Molecular Biology

  • Místo vydání

    Bethesda

  • Místo konání akce

    Montreal

  • Datum konání akce

    8. 9. 2003

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku