Homology Modelling and Molecular Dynamics Simulation of Beta-Galactosidase from Antarctic Bacterium Arthrobacter sp. C2-2 - sborník
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F03%3A00008977" target="_blank" >RIV/60461373:22330/03:00008977 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Homology Modelling and Molecular Dynamics Simulation of Beta-Galactosidase from Antarctic Bacterium Arthrobacter sp. C2-2 - sborník
Popis výsledku v původním jazyce
Enzymes from cold adapted organisms are gaining interest as catalysts in biotechnology. bGalactosidase from Antarctic bacterium Arthrobacter sp. C2 2 was used as a model enzyme to study the structural b asis of adaptation to function at low temperature. Since the experimental structure is not yet known we used methodology of homology modelling and molecular dynamics simulation. Model was built by the method of homology modelling by satisfaction of spatial restraints. bGalactosidase from E.coli (PDB identifier 1DP0) and human bglucuronidase (PDB identifier 1BHG) were used as templates. To evaluate and optimize the model, homology modelling procedure was followed by simulation of 1 ns molecular dynamics. Presented work describes results of moleculardynamics simulation and their implication for understanding of mechanism of adaptation . Predicted structure of the enzyme is compared with its mesophilic counterpart and roles of electrostatic and hydrophobic interactions in adaptation ar
Název v anglickém jazyce
Homology Modelling and Molecular Dynamics Simulation of Beta-Galactosidase from Antarctic Bacterium Arthrobacter sp. C2-2 - sborník
Popis výsledku anglicky
Enzymes from cold adapted organisms are gaining interest as catalysts in biotechnology. bGalactosidase from Antarctic bacterium Arthrobacter sp. C2 2 was used as a model enzyme to study the structural b asis of adaptation to function at low temperature. Since the experimental structure is not yet known we used methodology of homology modelling and molecular dynamics simulation. Model was built by the method of homology modelling by satisfaction of spatial restraints. bGalactosidase from E.coli (PDB identifier 1DP0) and human bglucuronidase (PDB identifier 1BHG) were used as templates. To evaluate and optimize the model, homology modelling procedure was followed by simulation of 1 ns molecular dynamics. Presented work describes results of moleculardynamics simulation and their implication for understanding of mechanism of adaptation . Predicted structure of the enzyme is compared with its mesophilic counterpart and roles of electrostatic and hydrophobic interactions in adaptation ar
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA204%2F02%2F0843" target="_blank" >GA204/02/0843: Komplexní studium chladového přizpůsobení enzymů na molekulární úrovni a jejich uplatnění v biotechnologických procesech</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2003
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Molecular & Cellular Proteomics
ISBN
1535-9476
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
1
Strana od-do
763
Název nakladatele
American Society for Biochemistry and Molecular Biology
Místo vydání
Bethesda
Místo konání akce
Montreal
Datum konání akce
8. 9. 2003
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—