Nukleotidová sekvence, organizace a charakterizace plasmidu pA81 Achromobacter xylosoxidans A8 kódujícího geny katabolismu haloaromátů
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F08%3A00021213" target="_blank" >RIV/60461373:22330/08:00021213 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68378050:_____/08:00310140
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Nucleotide sequence, organization and characterization of the (halo)aromatic acid catabolic plasmid pA81 from Achromobacter xylosoxidans A8
Popis výsledku v původním jazyce
The complete 98,192bp nucleotide sequence was determined for plasmid pA81, which is harbored by the haloaromatic acid-degrading bacterium Achromobacter xylosoxidans A8. The majority of the 103 open reading frames identified on pA81 could be categorized as either "backbone" genes, genes encoding (halo)aromatic compound degradation, or heavy metal resistance determinants. The backbone genes controlled conjugative transfer, replication and plasmid stability, and were well conserved with other IncP1-beta plasmids. Genes encoding (halo)aromatic degradation were clustered within a type I transposon, TnAxI, and included two ring-hydroxylating oxygenases (ortho-halobenzoate oxygenase, salicylate 5-hydroxylase) and a modified ortho-cleavage pathway for chlorocatechol degradation. The cluster of heavy metal resistance determinants was contained within a Type II transposon TnAxII, and included a predicted P-type ATPase and cation diffusion facilitator system. Genes identical to those carried by T
Název v anglickém jazyce
Nucleotide sequence, organization and characterization of the (halo)aromatic acid catabolic plasmid pA81 from Achromobacter xylosoxidans A8
Popis výsledku anglicky
The complete 98,192bp nucleotide sequence was determined for plasmid pA81, which is harbored by the haloaromatic acid-degrading bacterium Achromobacter xylosoxidans A8. The majority of the 103 open reading frames identified on pA81 could be categorized as either "backbone" genes, genes encoding (halo)aromatic compound degradation, or heavy metal resistance determinants. The backbone genes controlled conjugative transfer, replication and plasmid stability, and were well conserved with other IncP1-beta plasmids. Genes encoding (halo)aromatic degradation were clustered within a type I transposon, TnAxI, and included two ring-hydroxylating oxygenases (ortho-halobenzoate oxygenase, salicylate 5-hydroxylase) and a modified ortho-cleavage pathway for chlorocatechol degradation. The cluster of heavy metal resistance determinants was contained within a Type II transposon TnAxII, and included a predicted P-type ATPase and cation diffusion facilitator system. Genes identical to those carried by T
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/1M0520" target="_blank" >1M0520: Centrum aplikované genomiky</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Research in Microbiology
ISSN
0923-2508
e-ISSN
—
Svazek periodika
159
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
BE - Belgické království
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000254807300006
EID výsledku v databázi Scopus
—