mMass data miner: open source alternativa pro analýzu hmotnostně spektrometrických dat
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F08%3A00021228" target="_blank" >RIV/60461373:22330/08:00021228 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60461373:22310/08:00020621
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
mMass data miner: an open source alternative for mass spectrometric data analysis
Popis výsledku v původním jazyce
Mass spectrometry is involved in many fields of modern biochemistry. It has become a common tool not only for precise mass measurement, but also for protein identification, peptide sequencing, the identification of various post-translational modifications (PTMs), and even for the structural characterisation of proteins or protein complexes. A variety of software tools exist for data analysis and interpretation, most of which are specifically connected with individual instruments. A number of programs and web-based tools (Mascot, Protein Prospector, Profound, Aldente, GPMAW, GNU polyxmass/massXpert, etc.) are available and mostly focus on an individual proteomic task. It is, however, hard to find any publicly available software that could be used for overall mass data interpretations from the raw data manipulation, peak labelling and the precise analysis of mass spectra across a broad range of proteomic experiments. To provide a solution to these problems we have developed mMass, a pack
Název v anglickém jazyce
mMass data miner: an open source alternative for mass spectrometric data analysis
Popis výsledku anglicky
Mass spectrometry is involved in many fields of modern biochemistry. It has become a common tool not only for precise mass measurement, but also for protein identification, peptide sequencing, the identification of various post-translational modifications (PTMs), and even for the structural characterisation of proteins or protein complexes. A variety of software tools exist for data analysis and interpretation, most of which are specifically connected with individual instruments. A number of programs and web-based tools (Mascot, Protein Prospector, Profound, Aldente, GPMAW, GNU polyxmass/massXpert, etc.) are available and mostly focus on an individual proteomic task. It is, however, hard to find any publicly available software that could be used for overall mass data interpretations from the raw data manipulation, peak labelling and the precise analysis of mass spectra across a broad range of proteomic experiments. To provide a solution to these problems we have developed mMass, a pack
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Rapid Communications in Mass Spectrometry
ISSN
0951-4198
e-ISSN
—
Svazek periodika
22
Číslo periodika v rámci svazku
6
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000254593700019
EID výsledku v databázi Scopus
—