Multisystem altruistic metadynamics-Well-tempered variant

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F17%3A43913703" target="_blank" >RIV/60461373:22330/17:43913703 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60461373:22340/17:43913703

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1063/1.4978939" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1063/1.4978939</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1063/1.4978939" target="_blank" >10.1063/1.4978939</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Multisystem altruistic metadynamics-Well-tempered variant

Popis výsledku v původním jazyce

Metadynamics method has been widely used to enhance sampling in molecular simulations. Its original form suffers two major drawbacks, poor convergence in complex (especially biomolecular) systems and its serial nature. The first drawback has been addressed by introduction of a convergent variant known as well-tempered metadynamics. The second was addressed by introduction of a parallel multisystem metadynamics referred to as altruistic metadynamics. Here, we combine both approaches into well-tempered altruistic metadynamics. We provide mathematical arguments and trial simulations to show that it accurately predicts free energy surfaces. Published by AIP Publishing.

Název v anglickém jazyce

Multisystem altruistic metadynamics-Well-tempered variant

Popis výsledku anglicky

Metadynamics method has been widely used to enhance sampling in molecular simulations. Its original form suffers two major drawbacks, poor convergence in complex (especially biomolecular) systems and its serial nature. The first drawback has been addressed by introduction of a convergent variant known as well-tempered metadynamics. The second was addressed by introduction of a parallel multisystem metadynamics referred to as altruistic metadynamics. Here, we combine both approaches into well-tempered altruistic metadynamics. We provide mathematical arguments and trial simulations to show that it accurately predicts free energy surfaces. Published by AIP Publishing.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10403 - Physical chemistry

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Chemical Physics

ISSN

0021-9606

e-ISSN

—

Svazek periodika

146

Číslo periodika v rámci svazku

12

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

"125103-i"-"125103-viii"

Kód UT WoS článku

000397929300072

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85016401517