Free Energy Surface Prediction by Flying Gaussian Method: Multi-System Representation
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22330%2F17%3A43913718" target="_blank" >RIV/60461373:22330/17:43913718 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60461373:22340/17:43913718
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b09337" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b09337</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.7b09337" target="_blank" >10.1021/acs.jpcb.7b09337</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Free Energy Surface Prediction by Flying Gaussian Method: Multi-System Representation
Popis výsledku v původním jazyce
Flying Gaussian method simulates multiple replicas of the studied system and enhances sampling by disfavoring replicas to simultaneously sample similar states. The bias potential used for this enhancement is highly dynamic when looking at individual replica, which raises concerns about the accuracy of free-energy surfaces predicted by reweighing methods. Here we show that the bias potential can be considered as static when looking at the simulation from a multisystem perspective. We present two equations that can be used to predict the free-energy surface, and we demonstrate their convergence.
Název v anglickém jazyce
Free Energy Surface Prediction by Flying Gaussian Method: Multi-System Representation
Popis výsledku anglicky
Flying Gaussian method simulates multiple replicas of the studied system and enhances sampling by disfavoring replicas to simultaneously sample similar states. The bias potential used for this enhancement is highly dynamic when looking at individual replica, which raises concerns about the accuracy of free-energy surfaces predicted by reweighing methods. Here we show that the bias potential can be considered as static when looking at the simulation from a multisystem perspective. We present two equations that can be used to predict the free-energy surface, and we demonstrate their convergence.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10403 - Physical chemistry
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Svazek periodika
121
Číslo periodika v rámci svazku
46
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
10479-10483
Kód UT WoS článku
000416495800006
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85034970501