Stoichiometric network analysis of MAPK signalling cascade

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60461373%3A22340%2F12%3A43894044" target="_blank" >RIV/60461373:22340/12:43894044 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Stoichiometric network analysis of MAPK signalling cascade

Popis výsledku v původním jazyce

The Mitogen Activated Protein Kinase (MAPK) cascade, one of most studied signalling systems, is a highly conserved series of three protein kinases that conducts information signals to operate diverse biological processes. This cascade topology has unexpected consequences for dynamics of the MAPK signalling. The Huang-Ferrell model of MAPK signal transduction produce nonlinear behaviour like bistability and oscillations. Using reaction network theory, we analysed the Huang-Ferrell model of MAPK, especially a system involving activation of MAPKKK and first of the two double-phosphorylation cascades. We found the smallest network which still preserves bistability but does not allow for oscillations, and identified the unstable subnetwork that evokes oscillatory behaviour. We analyzed the single-phosphorylation cascade model by using numerical continuation and determine what is the role of various subnetworks in forming the bistability. The SNA was used to find the smallest network which s

Název v anglickém jazyce

Stoichiometric network analysis of MAPK signalling cascade

Popis výsledku anglicky

The Mitogen Activated Protein Kinase (MAPK) cascade, one of most studied signalling systems, is a highly conserved series of three protein kinases that conducts information signals to operate diverse biological processes. This cascade topology has unexpected consequences for dynamics of the MAPK signalling. The Huang-Ferrell model of MAPK signal transduction produce nonlinear behaviour like bistability and oscillations. Using reaction network theory, we analysed the Huang-Ferrell model of MAPK, especially a system involving activation of MAPKKK and first of the two double-phosphorylation cascades. We found the smallest network which still preserves bistability but does not allow for oscillations, and identified the unstable subnetwork that evokes oscillatory behaviour. We analyzed the single-phosphorylation cascade model by using numerical continuation and determine what is the role of various subnetworks in forming the bistability. The SNA was used to find the smallest network which s

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

CI - Průmyslová chemie a chemické inženýrství

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ME10036" target="_blank" >ME10036: Vliv konvektivního toku na šíření chemického signálu v živých tkáních</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

20th International Congress of Chemical and Process Engineering

ISBN

978-80-905035-1-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

1-3

Název nakladatele

Orgit, s.r.o.

Místo vydání

Praha

Místo konání akce

Prague

Datum konání akce

25. 8. 2012

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—