Critical Effect of the N2 Amino Group on Structure, Dynamics, and Elasticity of DNA Polypurine Tracts.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388955%3A_____%2F02%3A54020086" target="_blank" >RIV/61388955:_____/02:54020086 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Critical Effect of the N2 Amino Group on Structure, Dynamics, and Elasticity of DNA Polypurine Tracts.

Popis výsledku v původním jazyce

Unrestrained 5-20-ns explicit-solvent molecular dynamics simulations using the Cornell et al. forcefield have been carried out for d[GCG(N)11GCG]2 (N, purine base) considering guanine-cytosine, adenine-thymine, inosine-5-methyl-cytosine, and 2-amino-adenine-thymine basepairs. The critical effect of the N2 amino group on the structure, dynamics and elasticity of DNA polypurine tracts was studied. Our conclusions are entirely consistent with available experimental data.

Název v anglickém jazyce

Critical Effect of the N2 Amino Group on Structure, Dynamics, and Elasticity of DNA Polypurine Tracts.

Popis výsledku anglicky

Unrestrained 5-20-ns explicit-solvent molecular dynamics simulations using the Cornell et al. forcefield have been carried out for d[GCG(N)11GCG]2 (N, purine base) considering guanine-cytosine, adenine-thymine, inosine-5-methyl-cytosine, and 2-amino-adenine-thymine basepairs. The critical effect of the N2 amino group on the structure, dynamics and elasticity of DNA polypurine tracts was studied. Our conclusions are entirely consistent with available experimental data.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CH - Jaderná a kvantová chemie, fotochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LN00A032" target="_blank" >LN00A032: Struktura a dynamika komplexních molekulových systémů a biomolekul</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2002

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Biophysical Journal

ISSN

0006-3495

e-ISSN

—

Svazek periodika

82

Číslo periodika v rámci svazku

5

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

18

Strana od-do

2592-2609

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—