Povrchy potenciální energie mikrohydratovaného páru guanin...cytosin a jeho methylovaného derivátu
Popis výsledku
Povrchy potenciální energie párů bází guanin ... cytosin a jejich methylovaných derivátů v přítomnosti jedné a dvou molekul vody byly studovány metodou molekulové dynamiky-quenchingu. Nejstabilnější struktury byly dale reoptimizovány na korelované ab initio úrovni. V textu je rovněž diskutováno odlišné chování páru adenin...thymin. Tyto studie jsou důležité pro nalezení hydratačních míst kolem bází a pro pochopení vlivu solventu na stabilitu struktury DNA.
Klíčová slova
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Potential energy surfaces of the microhydrated guanine...cytosine base pair and its methylated analogue
Popis výsledku v původním jazyce
A scan of the potential and free-energy surfaces of monohydrated and dihydrated guanine...cytosine and 9-methylguanine...1-methylcytosine base pairs was realized by the molecular dynamics/quenching technique using the force field of Cornell et al. The most stable and populated structures localized were further fully reoptimized at the correlated ab initio level employingthe resolution of identity Moller?Plesset method with a large basis set. The different behavior of guanine ... cytosine and adenine ...thymine complexes is discussed. These studies of nucleic acid base pairs are important for finding binding sites of water molecules around bases and for better understanding of the influence of the solvent on the stability of the structure of DNA.
Název v anglickém jazyce
Potential energy surfaces of the microhydrated guanine...cytosine base pair and its methylated analogue
Popis výsledku anglicky
A scan of the potential and free-energy surfaces of monohydrated and dihydrated guanine...cytosine and 9-methylguanine...1-methylcytosine base pairs was realized by the molecular dynamics/quenching technique using the force field of Cornell et al. The most stable and populated structures localized were further fully reoptimized at the correlated ab initio level employingthe resolution of identity Moller?Plesset method with a large basis set. The different behavior of guanine ... cytosine and adenine ...thymine complexes is discussed. These studies of nucleic acid base pairs are important for finding binding sites of water molecules around bases and for better understanding of the influence of the solvent on the stability of the structure of DNA.
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2006
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
ChemPhysCHem
ISSN
1439-4235
e-ISSN
—
Svazek periodika
7
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
DE - Spolková republika Německo
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
439-447
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—
Základní informace
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Rok uplatnění
2006