Microhydration of guanine cytosine base pairs, a theoretical study on the role of water in stability, structure and tautomeric equilibrium

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F09%3A00328010" target="_blank" >RIV/61388963:_____/09:00328010 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Microhydration of guanine cytosine base pairs, a theoretical study on the role of water in stability, structure and tautomeric equilibrium

Popis výsledku v původním jazyce

The potential energy surfaces of guanine...cytosine complexes and microhydrated guanine... cytosine were investigated by the molecular dynamics/ quenching method (MD/Q), using the AMBER force field, The calculations were conducted for all the possible combinations of the four most stable tautomers of guanine and three of cytosine (covering the canonical forms in both cases). The most stable structures found at the empirical potential energy surfaces were fully reoptimised at the second-order M?ller?Plesset perturbation theory as well as using the density functional method The rising number of water molecules leads to smaller differences between the stability of the various combinations of the tautomers of bases in the base pairs.

Název v anglickém jazyce

Microhydration of guanine cytosine base pairs, a theoretical study on the role of water in stability, structure and tautomeric equilibrium

Popis výsledku anglicky

The potential energy surfaces of guanine...cytosine complexes and microhydrated guanine... cytosine were investigated by the molecular dynamics/ quenching method (MD/Q), using the AMBER force field, The calculations were conducted for all the possible combinations of the four most stable tautomers of guanine and three of cytosine (covering the canonical forms in both cases). The most stable structures found at the empirical potential energy surfaces were fully reoptimised at the second-order M?ller?Plesset perturbation theory as well as using the density functional method The rising number of water molecules leads to smaller differences between the stability of the various combinations of the tautomers of bases in the base pairs.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2009

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Physical Chemistry Chemical Physics

ISSN

1463-9076

e-ISSN

—

Svazek periodika

11

Číslo periodika v rámci svazku

18

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000265413300010

EID výsledku v databázi Scopus

—