Pyramidalization of the Glycosidic Nitrogen Provides the Way for Efficient Cleavage of the N-Glycosidic Bond of 8-OxoG with the hOGG1 DNA Repair Protein
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F12%3A00382846" target="_blank" >RIV/61388963:_____/12:00382846 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/jp309098d" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/jp309098d</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/jp309098d" target="_blank" >10.1021/jp309098d</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Pyramidalization of the Glycosidic Nitrogen Provides the Way for Efficient Cleavage of the N-Glycosidic Bond of 8-OxoG with the hOGG1 DNA Repair Protein
Popis výsledku v původním jazyce
A mechanistic pathway for cleavage of the N-glycosidic bond of 8-oxo-2-deoxyguanosine (oxoG) catalyzed with the human 8-oxoguanine glycosylase 1 DNA repair protein (hOGG1) is proposed in this theoretical study. The reaction scheme suggests direct protonaddition to the glycosidic nitrogen N9 of oxoG from the N?-ammonium of Lys249 residue of hOGG1 that is enabled owing to the N9 pyramidal geometry. The modification of aromatic character introduced by oxidation to the nucleobase thus seems to be the factor that is checked by hOGG1 to achieve base-specific cleavage.
Název v anglickém jazyce
Pyramidalization of the Glycosidic Nitrogen Provides the Way for Efficient Cleavage of the N-Glycosidic Bond of 8-OxoG with the hOGG1 DNA Repair Protein
Popis výsledku anglicky
A mechanistic pathway for cleavage of the N-glycosidic bond of 8-oxo-2-deoxyguanosine (oxoG) catalyzed with the human 8-oxoguanine glycosylase 1 DNA repair protein (hOGG1) is proposed in this theoretical study. The reaction scheme suggests direct protonaddition to the glycosidic nitrogen N9 of oxoG from the N?-ammonium of Lys249 residue of hOGG1 that is enabled owing to the N9 pyramidal geometry. The modification of aromatic character introduced by oxidation to the nucleobase thus seems to be the factor that is checked by hOGG1 to achieve base-specific cleavage.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GAP205%2F10%2F0228" target="_blank" >GAP205/10/0228: Struktura a dynamika bioinorganických komplexů</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Svazek periodika
116
Číslo periodika v rámci svazku
41
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
12535-12544
Kód UT WoS článku
000309902400016
EID výsledku v databázi Scopus
—