Interactions of Model Biomolecules. Benchmark CC Calculations within MOLCAS
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F15%3A00455141" target="_blank" >RIV/61388963:_____/15:00455141 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1063/1.4906645" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1063/1.4906645</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1063/1.4906645" target="_blank" >10.1063/1.4906645</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Interactions of Model Biomolecules. Benchmark CC Calculations within MOLCAS
Popis výsledku v původním jazyce
We present results using the OVOS approach (Optimized Virtual Orbitals Space) aimed at enhancing the effectiveness of the Coupled Cluster calculations. This approach allows to reduce the total computer time required for large-scale CCSD(T) calculations about ten times when the original full virtual space is reduced to about 50% of its original size without affecting the accuracy. The method is implemented in the MOLCAS computer program. When combined with the Cholesky decomposition of the two-electron integrals and suitable parallelization it allows calculations which were formerly prohibitively too demanding. We focused ourselves to accurate calculations of the hydrogen bonded and the stacking interactions of the model biomolecules. Interaction energies of the formaldehyde, formamide, benzene, and uracil dimers and the three-body contributions in the cytosine - guanine tetramer are presented. Other applications, as the electron affinity of the uracil affected by solvation are also sho
Název v anglickém jazyce
Interactions of Model Biomolecules. Benchmark CC Calculations within MOLCAS
Popis výsledku anglicky
We present results using the OVOS approach (Optimized Virtual Orbitals Space) aimed at enhancing the effectiveness of the Coupled Cluster calculations. This approach allows to reduce the total computer time required for large-scale CCSD(T) calculations about ten times when the original full virtual space is reduced to about 50% of its original size without affecting the accuracy. The method is implemented in the MOLCAS computer program. When combined with the Cholesky decomposition of the two-electron integrals and suitable parallelization it allows calculations which were formerly prohibitively too demanding. We focused ourselves to accurate calculations of the hydrogen bonded and the stacking interactions of the model biomolecules. Interaction energies of the formaldehyde, formamide, benzene, and uracil dimers and the three-body contributions in the cytosine - guanine tetramer are presented. Other applications, as the electron affinity of the uracil affected by solvation are also sho
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Proceedings of the International Conference of Computational Methods in Sciences and Engineering 2010 (ICCMSE-2010)
ISBN
978-0-7354-1282-8
ISSN
0094-243X
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
178-181
Název nakladatele
AIP Publishing
Místo vydání
Melville
Místo konání akce
Psalidi
Datum konání akce
3. 10. 2010
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
000354845400020