Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Arginine side chain interactions and the role of arginine as a gating charge carrier in voltage sensitive ion channels

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F16%3A00458857" target="_blank" >RIV/61388963:_____/16:00458857 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.nature.com/articles/srep21759" target="_blank" >http://www.nature.com/articles/srep21759</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep21759" target="_blank" >10.1038/srep21759</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Arginine side chain interactions and the role of arginine as a gating charge carrier in voltage sensitive ion channels

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Gating charges in voltage-sensing domains (VSD) of voltage-sensitive ion channels and enzymes are carried on arginine side chains rather than lysine. This arginine preference may result from the unique hydration properties of the side chain guanidinium group which facilitates its movement through a hydrophobic plug that seals the center of the VSD, as suggested by molecular dynamics simulations. To test for side chain interactions implicit in this model we inspected interactions of the side chains of arginine and lysine with each of the 19 non-glycine amino acids in proteins in the protein data bank. The arginine guanidinium interacts with non-polar aromatic and aliphatic side chains above and below the guanidinium plane while hydrogen bonding with polar side chains is restricted to in-plane positions. In contrast, non-polar side chains interact largely with the aliphatic part of the lysine side chain. The hydration properties of arginine and lysine are strongly reflected in their respective interactions with non-polar and polar side chains as observed in protein structures and in molecular dynamics simulations, and likely underlie the preference for arginine as a mobile charge carrier in VSD.

  • Název v anglickém jazyce

    Arginine side chain interactions and the role of arginine as a gating charge carrier in voltage sensitive ion channels

  • Popis výsledku anglicky

    Gating charges in voltage-sensing domains (VSD) of voltage-sensitive ion channels and enzymes are carried on arginine side chains rather than lysine. This arginine preference may result from the unique hydration properties of the side chain guanidinium group which facilitates its movement through a hydrophobic plug that seals the center of the VSD, as suggested by molecular dynamics simulations. To test for side chain interactions implicit in this model we inspected interactions of the side chains of arginine and lysine with each of the 19 non-glycine amino acids in proteins in the protein data bank. The arginine guanidinium interacts with non-polar aromatic and aliphatic side chains above and below the guanidinium plane while hydrogen bonding with polar side chains is restricted to in-plane positions. In contrast, non-polar side chains interact largely with the aliphatic part of the lysine side chain. The hydration properties of arginine and lysine are strongly reflected in their respective interactions with non-polar and polar side chains as observed in protein structures and in molecular dynamics simulations, and likely underlie the preference for arginine as a mobile charge carrier in VSD.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Scientific Reports

  • ISSN

    2045-2322

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    6

  • Číslo periodika v rámci svazku

    Feb 22

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000370513000001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-84959160794