Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Sensitive Versatile Fluorogenic Transmembrane Peptide Substrates for Rhomboid Intramembrane Proteases

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F17%3A00475159" target="_blank" >RIV/61388963:_____/17:00475159 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11310/17:10361731 RIV/00216208:11110/17:10361731 RIV/70883521:28110/17:63517120

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.jbc.org/content/292/7/2703.full" target="_blank" >http://www.jbc.org/content/292/7/2703.full</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M116.762849" target="_blank" >10.1074/jbc.M116.762849</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Sensitive Versatile Fluorogenic Transmembrane Peptide Substrates for Rhomboid Intramembrane Proteases

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Rhomboid proteases are increasingly being explored as potential drug targets, but their potent and specific inhibitors are not available, and strategies for inhibitor development are hampered by the lack of widely usable and easily modifiable in vitro activity assays. Here we address this bottleneck and report on the development of new fluorogenic transmembrane peptide substrates, which are cleaved by several unrelated rhomboid proteases, can be used both in detergent micelles and in liposomes, and contain red-shifted fluorophores that are suitable for high-throughput screening of compound libraries. We show that nearly the entire transmembrane domain of the substrate is important for efficient cleavage, implying that it extensively interacts with the enzyme. Importantly, we demonstrate that in the detergent micelle system, commonly used for the enzymatic analyses of intramembrane proteolysis, the cleavage rate strongly depends on detergent concentration, because the reaction proceeds only in the micelles. Furthermore, we show that the catalytic efficiency and selectivity toward a rhomboid substrate can be dramatically improved by targeted modification of the sequence of its P5 to P1 region. The fluorogenic substrates that we describe and their sequence variants should find wide use in the detection of activity and development of inhibitors of rhomboid proteases.

  • Název v anglickém jazyce

    Sensitive Versatile Fluorogenic Transmembrane Peptide Substrates for Rhomboid Intramembrane Proteases

  • Popis výsledku anglicky

    Rhomboid proteases are increasingly being explored as potential drug targets, but their potent and specific inhibitors are not available, and strategies for inhibitor development are hampered by the lack of widely usable and easily modifiable in vitro activity assays. Here we address this bottleneck and report on the development of new fluorogenic transmembrane peptide substrates, which are cleaved by several unrelated rhomboid proteases, can be used both in detergent micelles and in liposomes, and contain red-shifted fluorophores that are suitable for high-throughput screening of compound libraries. We show that nearly the entire transmembrane domain of the substrate is important for efficient cleavage, implying that it extensively interacts with the enzyme. Importantly, we demonstrate that in the detergent micelle system, commonly used for the enzymatic analyses of intramembrane proteolysis, the cleavage rate strongly depends on detergent concentration, because the reaction proceeds only in the micelles. Furthermore, we show that the catalytic efficiency and selectivity toward a rhomboid substrate can be dramatically improved by targeted modification of the sequence of its P5 to P1 region. The fluorogenic substrates that we describe and their sequence variants should find wide use in the detection of activity and development of inhibitors of rhomboid proteases.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Biological Chemistry

  • ISSN

    0021-9258

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    292

  • Číslo periodika v rámci svazku

    7

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    2703-2713

  • Kód UT WoS článku

    000395535100013

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85013219026