Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Activity Assays for Rhomboid Proteases

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F17%3A00483419" target="_blank" >RIV/61388963:_____/17:00483419 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/bs.mie.2016.11.002" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/bs.mie.2016.11.002</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/bs.mie.2016.11.002" target="_blank" >10.1016/bs.mie.2016.11.002</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Activity Assays for Rhomboid Proteases

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Rhomboids are ubiquitous intramembrane serine proteases that are involved in various signaling pathways. This fascinating class of proteases harbors an active site buried within the lipid milieu. High-resolution structures of the Escherichia coli rhomboid GlpG with various inhibitors revealed the catalytic mechanism for rhomboid-mediated proteolysis, however, a quantitative characterization was lacking. Assessing an enzyme's catalytic parameters is important for understanding the details of its proteolytic reaction and regulatory mechanisms. To assay rhomboid protease activity, many challenges exist such as the lipid environment and lack of known substrates. Here, we summarize various enzymatic assays developed over the last decade to study rhomboid protease activity. We present detailed protocols for gel-shift and FRET-based assays, and calculation of KM and V-max to measure catalytic parameters, using detergent solubilized rhomboids with TatA, the only known substrate for bacterial rhomboids, and the model substrate fluorescently labeled casein.

  • Název v anglickém jazyce

    Activity Assays for Rhomboid Proteases

  • Popis výsledku anglicky

    Rhomboids are ubiquitous intramembrane serine proteases that are involved in various signaling pathways. This fascinating class of proteases harbors an active site buried within the lipid milieu. High-resolution structures of the Escherichia coli rhomboid GlpG with various inhibitors revealed the catalytic mechanism for rhomboid-mediated proteolysis, however, a quantitative characterization was lacking. Assessing an enzyme's catalytic parameters is important for understanding the details of its proteolytic reaction and regulatory mechanisms. To assay rhomboid protease activity, many challenges exist such as the lipid environment and lack of known substrates. Here, we summarize various enzymatic assays developed over the last decade to study rhomboid protease activity. We present detailed protocols for gel-shift and FRET-based assays, and calculation of KM and V-max to measure catalytic parameters, using detergent solubilized rhomboids with TatA, the only known substrate for bacterial rhomboids, and the model substrate fluorescently labeled casein.

Klasifikace

  • Druh

    C - Kapitola v odborné knize

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název knihy nebo sborníku

    Enzymology at the Membrane Interface: Intramembrane Proteases

  • ISBN

    978-0-12-812213-6

  • Počet stran výsledku

    43

  • Strana od-do

    395-437

  • Počet stran knihy

    474

  • Název nakladatele

    Academic Press

  • Místo vydání

    Cambridge

  • Kód UT WoS kapitoly

    000403271000016