Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Novel (p)ppGpp Binding and Metabolizing Proteins of Escherichia coli

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F18%3A00490330" target="_blank" >RIV/61388963:_____/18:00490330 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://mbio.asm.org/content/9/2/e02188-17.full" target="_blank" >http://mbio.asm.org/content/9/2/e02188-17.full</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1128/mBio.02188-17" target="_blank" >10.1128/mBio.02188-17</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Novel (p)ppGpp Binding and Metabolizing Proteins of Escherichia coli

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The alarmone (p) ppGpp plays pivotal roles in basic bacterial stress responses by increasing tolerance of various nutritional limitations and chemical insults, including antibiotics. Despite intensive studies since (p) ppGpp was discovered over 4 decades ago, (p) ppGpp binding proteins have not been systematically identified in Escherichia coli. We applied DRaCALA (differential radial capillary action of ligand assay) to identify (p) ppGpp-protein interactions. We discovered 12 new (p) ppGpp targets in E. coli that, based on their physiological functions, could be classified into four major groups, involved in (i) purine nucleotide homeostasis (YgdH), (ii) ribosome biogenesis and translation (RsgA, Era, HflX, and LepA), (iii) maturation of dehydrogenases (HypB), and (iv) metabolism of (p) ppGpp (MutT, NudG, TrmE, NadR, PhoA, and UshA). We present a comprehensive and comparative biochemical and physiological characterization of these novel (p) ppGpp targets together with a comparative analysis of relevant, known (p) ppGpp binding proteins. Via this, primary targets of (p) ppGpp in E. coli are identified. The GTP salvage biosynthesis pathway and ribosome biogenesis and translation are confirmed as targets of (p) ppGpp that are highly conserved between E. coli and Firmicutes. In addition, an alternative (p) ppGpp degradative pathway, involving NudG and MutT, was uncovered. This report thus significantly expands the known cohort of (p) ppGpp targets in E. coli.

  • Název v anglickém jazyce

    Novel (p)ppGpp Binding and Metabolizing Proteins of Escherichia coli

  • Popis výsledku anglicky

    The alarmone (p) ppGpp plays pivotal roles in basic bacterial stress responses by increasing tolerance of various nutritional limitations and chemical insults, including antibiotics. Despite intensive studies since (p) ppGpp was discovered over 4 decades ago, (p) ppGpp binding proteins have not been systematically identified in Escherichia coli. We applied DRaCALA (differential radial capillary action of ligand assay) to identify (p) ppGpp-protein interactions. We discovered 12 new (p) ppGpp targets in E. coli that, based on their physiological functions, could be classified into four major groups, involved in (i) purine nucleotide homeostasis (YgdH), (ii) ribosome biogenesis and translation (RsgA, Era, HflX, and LepA), (iii) maturation of dehydrogenases (HypB), and (iv) metabolism of (p) ppGpp (MutT, NudG, TrmE, NadR, PhoA, and UshA). We present a comprehensive and comparative biochemical and physiological characterization of these novel (p) ppGpp targets together with a comparative analysis of relevant, known (p) ppGpp binding proteins. Via this, primary targets of (p) ppGpp in E. coli are identified. The GTP salvage biosynthesis pathway and ribosome biogenesis and translation are confirmed as targets of (p) ppGpp that are highly conserved between E. coli and Firmicutes. In addition, an alternative (p) ppGpp degradative pathway, involving NudG and MutT, was uncovered. This report thus significantly expands the known cohort of (p) ppGpp targets in E. coli.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA15-11711S" target="_blank" >GA15-11711S: Vývoj molekulárních nástrojů pro ovlivňování a výzkum bakteriální stringentní odpovědi</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    mBio

  • ISSN

    2150-7511

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    20

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000431279600021

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85046494288