Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

The LOTUS initiative for open knowledge management in natural products research

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F22%3A00564064" target="_blank" >RIV/61388963:_____/22:00564064 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.7554/eLife.70780" target="_blank" >https://doi.org/10.7554/eLife.70780</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.7554/eLife.70780" target="_blank" >10.7554/eLife.70780</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    The LOTUS initiative for open knowledge management in natural products research

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Contemporary bioinformatic and chemoinformatic capabilities hold promise to reshape knowledge management, analysis and interpretation of data in natural products research. Currently, reliance on a disparate set of non--standardized, insular, and specialized databases presents a series of challenges for data access, both within the discipline and for integration and interoperability between related fields. The fundamental elements of exchange are referenced structure--organism pairs that establish relationships between distinct molecular structures and the living organisms from which they were identified. Consolidating and sharing such information via an open platform has strong transformative potential for natural products research and beyond. This is the ultimate goal of the newly established LOTUS initiative, which has now completed the first steps toward the harmonization, curation, validation and open dissemination of 750,000+ referenced structure--organism pairs. LOTUS data is hosted on Wikidata and regularly mirrored on https://lotus.naturalproducts.net. Data sharing within the Wikidata framework broadens data access and interoperability, opening new possibilities for community curation and evolving publication models. Furthermore, embedding LOTUS data into the vast Wikidata knowledge graph will facilitate new biological and chemical insights. The LOTUS initiative represents an important advancement in the design and deployment of a comprehensive and collaborative natural products knowledge base.

  • Název v anglickém jazyce

    The LOTUS initiative for open knowledge management in natural products research

  • Popis výsledku anglicky

    Contemporary bioinformatic and chemoinformatic capabilities hold promise to reshape knowledge management, analysis and interpretation of data in natural products research. Currently, reliance on a disparate set of non--standardized, insular, and specialized databases presents a series of challenges for data access, both within the discipline and for integration and interoperability between related fields. The fundamental elements of exchange are referenced structure--organism pairs that establish relationships between distinct molecular structures and the living organisms from which they were identified. Consolidating and sharing such information via an open platform has strong transformative potential for natural products research and beyond. This is the ultimate goal of the newly established LOTUS initiative, which has now completed the first steps toward the harmonization, curation, validation and open dissemination of 750,000+ referenced structure--organism pairs. LOTUS data is hosted on Wikidata and regularly mirrored on https://lotus.naturalproducts.net. Data sharing within the Wikidata framework broadens data access and interoperability, opening new possibilities for community curation and evolving publication models. Furthermore, embedding LOTUS data into the vast Wikidata knowledge graph will facilitate new biological and chemical insights. The LOTUS initiative represents an important advancement in the design and deployment of a comprehensive and collaborative natural products knowledge base.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LM2018131" target="_blank" >LM2018131: Česká národní infrastruktura pro biologická data</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    eLife

  • ISSN

    2050-084X

  • e-ISSN

    2050-084X

  • Svazek periodika

    11

  • Číslo periodika v rámci svazku

    May

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    41

  • Strana od-do

    e70780

  • Kód UT WoS článku

    000880054700001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85130833383