Charakterizace flexibilní složky genomu komensálního kmene Escherichia coli A0 34/86 (O83 : K24 : H31)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F05%3A00022215" target="_blank" >RIV/61388971:_____/05:00022215 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Characterization of the flexible genome complement of the commensal Escherichia coli strain A0 34/86 (O83:K24:H31)

Popis výsledku v původním jazyce

Colonization by the commensal Escherichia coli strain A0 34/86 (O83 : K24 : H31) has proved to be safe and efficient in the prophylaxis and treatment of nosocomial infections and diarrhoea of preterm and newborn infants in Czech paediatric clinics over the past three decades. In searching for traits contributing to this beneficial effect related to the gut colonization capacity of the strain, the authors have analysed its genome by DNA-DNA hybridization to E. coli K-12 (MG1655) genomic DNA arrays and to'Pathoarrays', as well as by multiplex PCR, bacterial artificial chromosome (BAC) library cloning and shotgun sequencing. Four hundred and ten E. coli K-12 ORFs were absent from A0 34/86, while 72 out of 456 genes associated with pathogenicity islands of E. coli and Shigella were also detected in E. coli A0 34/86

Název v anglickém jazyce

Characterization of the flexible genome complement of the commensal Escherichia coli strain A0 34/86 (O83:K24:H31)

Popis výsledku anglicky

Colonization by the commensal Escherichia coli strain A0 34/86 (O83 : K24 : H31) has proved to be safe and efficient in the prophylaxis and treatment of nosocomial infections and diarrhoea of preterm and newborn infants in Czech paediatric clinics over the past three decades. In searching for traits contributing to this beneficial effect related to the gut colonization capacity of the strain, the authors have analysed its genome by DNA-DNA hybridization to E. coli K-12 (MG1655) genomic DNA arrays and to'Pathoarrays', as well as by multiplex PCR, bacterial artificial chromosome (BAC) library cloning and shotgun sequencing. Four hundred and ten E. coli K-12 ORFs were absent from A0 34/86, while 72 out of 456 genes associated with pathogenicity islands of E. coli and Shigella were also detected in E. coli A0 34/86

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/IBS5020311" target="_blank" >IBS5020311: Vakcíny pro indukci slizniční a systemické imunity</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Microbiology

ISSN

0001-9539

e-ISSN

—

Svazek periodika

2005

Číslo periodika v rámci svazku

-

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

14

Strana od-do

385-398

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—