Specifické oblasti genomové plasticity a genetická diverzita komenzálního kmene Escherichia coli A0 34/86

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F06%3A00044187" target="_blank" >RIV/61388971:_____/06:00044187 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Specific regions of genome plasticity and genetic diversity of the commensal Escherichia coli A0 34/86

Popis výsledku v původním jazyce

Escherichia coli A0 34/86 (O83.K24.H31) is a commensal strain that has been used for prophylactic and therapeutic colonization of the intestine of newborn infants. To identify traits specific for E. coli A0 34/86, we used a minimal tiling set of 148 BACclones of A0 34/86 genomic DNA, to construct restriction-digested BAC arrays. Hybridization with genomic DNA from four E. coli strains (CFT073, O157.H7, K12 and Nissle 1917) allowed selection of two BAC clones that were sequenced to identify A0 34/86-specific regions. Genes for the yersiniabactin siderophore system, several proteins homologous to Salmonella enterica serovar Typhimurium vitamin B12 synthesis proteins, as well as genes necessary for the degradation of propanediol, the pix fimbriae determinant and genes coding for a putative phosphoglycerate transport system present also on pathogenicity island V of E. coli strain 536 were all identified in E. coli A0 34/86

Název v anglickém jazyce

Specific regions of genome plasticity and genetic diversity of the commensal Escherichia coli A0 34/86

Popis výsledku anglicky

Escherichia coli A0 34/86 (O83.K24.H31) is a commensal strain that has been used for prophylactic and therapeutic colonization of the intestine of newborn infants. To identify traits specific for E. coli A0 34/86, we used a minimal tiling set of 148 BACclones of A0 34/86 genomic DNA, to construct restriction-digested BAC arrays. Hybridization with genomic DNA from four E. coli strains (CFT073, O157.H7, K12 and Nissle 1917) allowed selection of two BAC clones that were sequenced to identify A0 34/86-specific regions. Genes for the yersiniabactin siderophore system, several proteins homologous to Salmonella enterica serovar Typhimurium vitamin B12 synthesis proteins, as well as genes necessary for the degradation of propanediol, the pix fimbriae determinant and genes coding for a putative phosphoglycerate transport system present also on pathogenicity island V of E. coli strain 536 were all identified in E. coli A0 34/86

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

International Journal of Medical Microbiology

ISSN

1438-4221

e-ISSN

—

Svazek periodika

296

Číslo periodika v rámci svazku

-

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

541-546

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—