Sequence diversity in haloalkane dehalogenases, as revealed by PCR using family-specific primers

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F12%3A00378920" target="_blank" >RIV/61388971:_____/12:00378920 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.11.013" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.11.013</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.mimet.2011.11.013" target="_blank" >10.1016/j.mimet.2011.11.013</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Sequence diversity in haloalkane dehalogenases, as revealed by PCR using family-specific primers

Popis výsledku v původním jazyce

Haloalkane dehalogenases (HLDs) are hydrolytic enzymes that cleave carbon-halogen bonds in various halogenated compounds. Interest initially grew in HLDs as biocatalysts for bioremediation and later for biotransformation applications; each specific HLD within the HLD family has its own substrate specificity, enantioselectivity and product inhibition characteristics. We developed degenerate oligonucleotide primers for HLD-encoding genes and used these to PCR-amplify large hid gene fragments using genomicDNA from the microbial community of a chlorinated-solvent-contaminated aquifer as a template. An analysis of small subunit ribosomal RNA genes revealed a high complexity in the eubacterial population, dominated by alpha-, beta- and gamma-Proteobacteria,and Acidobacteria

Název v anglickém jazyce

Sequence diversity in haloalkane dehalogenases, as revealed by PCR using family-specific primers

Popis výsledku anglicky

Haloalkane dehalogenases (HLDs) are hydrolytic enzymes that cleave carbon-halogen bonds in various halogenated compounds. Interest initially grew in HLDs as biocatalysts for bioremediation and later for biotransformation applications; each specific HLD within the HLD family has its own substrate specificity, enantioselectivity and product inhibition characteristics. We developed degenerate oligonucleotide primers for HLD-encoding genes and used these to PCR-amplify large hid gene fragments using genomicDNA from the microbial community of a chlorinated-solvent-contaminated aquifer as a template. An analysis of small subunit ribosomal RNA genes revealed a high complexity in the eubacterial population, dominated by alpha-, beta- and gamma-Proteobacteria,and Acidobacteria

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Microbiological Methods

ISSN

0167-7012

e-ISSN

—

Svazek periodika

88

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

212-217

Kód UT WoS článku

000301165400004

EID výsledku v databázi Scopus

—