In-depth analysis of cis-determinants that either promote or inhibit reinitiation on GCN4 mRNA after translation of its four short uORFs
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F16%3A00459969" target="_blank" >RIV/61388971:_____/16:00459969 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1261/rna.055046.115" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1261/rna.055046.115</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1261/rna.055046.115" target="_blank" >10.1261/rna.055046.115</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
In-depth analysis of cis-determinants that either promote or inhibit reinitiation on GCN4 mRNA after translation of its four short uORFs
Popis výsledku v původním jazyce
Translational control in eukaryotes is exerted by many means, one of which involves a ribosome translating multiple cistrons per mRNA as in bacteria. It is called reinitiation (REI) and occurs on mRNAs where the main ORF is preceded by a short upstream uORF(s). Some uORFs support efficient REI on downstream cistrons, whereas some others do not. The mRNA of yeast transcriptional activator GCN4 contains four uORFs of both types that together compose an intriguing regulatory mechanism of its expression responding to nutrients' availability and various stresses. Here we subjected all GCN4 uORFs to a comprehensive analysis to identify all REI-promoting and inhibiting cis-determinants that contribute either autonomously or in synergy to the overall efficiency of REI on GCN4. We found that the 3' sequences of uORFs 1-3 contain a conserved AU(1-2)A/UUAU(2) motif that promotes REI in position-specific, autonomous fashion such as the REI-promoting elements occurring in 5' sequences of uORF1 and uORF2.
Název v anglickém jazyce
In-depth analysis of cis-determinants that either promote or inhibit reinitiation on GCN4 mRNA after translation of its four short uORFs
Popis výsledku anglicky
Translational control in eukaryotes is exerted by many means, one of which involves a ribosome translating multiple cistrons per mRNA as in bacteria. It is called reinitiation (REI) and occurs on mRNAs where the main ORF is preceded by a short upstream uORF(s). Some uORFs support efficient REI on downstream cistrons, whereas some others do not. The mRNA of yeast transcriptional activator GCN4 contains four uORFs of both types that together compose an intriguing regulatory mechanism of its expression responding to nutrients' availability and various stresses. Here we subjected all GCN4 uORFs to a comprehensive analysis to identify all REI-promoting and inhibiting cis-determinants that contribute either autonomously or in synergy to the overall efficiency of REI on GCN4. We found that the 3' sequences of uORFs 1-3 contain a conserved AU(1-2)A/UUAU(2) motif that promotes REI in position-specific, autonomous fashion such as the REI-promoting elements occurring in 5' sequences of uORF1 and uORF2.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GAP305%2F11%2F0172" target="_blank" >GAP305/11/0172: Molekulární podstata genově specifického mechanismu translační kontroly kvasinkového genu GCN4, a genu jeho savčího funkčního homologa ATF4.</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
R N A
ISSN
1355-8382
e-ISSN
—
Svazek periodika
22
Číslo periodika v rámci svazku
4
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
17
Strana od-do
542-558
Kód UT WoS článku
000372766700006
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-84962550055