Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

sigma(I) from Bacillus subtilis: Impact on Gene Expression and Characterization of sigma(I)-Dependent Transcription That Requires New Types of Promoters with Extended-35 and-10 Elements

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F18%3A00493283" target="_blank" >RIV/61388971:_____/18:00493283 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11310/18:10383396

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1128/JB.00251-18" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1128/JB.00251-18</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1128/JB.00251-18" target="_blank" >10.1128/JB.00251-18</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    sigma(I) from Bacillus subtilis: Impact on Gene Expression and Characterization of sigma(I)-Dependent Transcription That Requires New Types of Promoters with Extended-35 and-10 Elements

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The sigma(I) sigma factor from Bacillus subtilis is a a factor associated with RNA polymerase (RNAP) that was previously implicated in adaptation of the cell to elevated temperature. Here, we provide a comprehensive characterization of this transcriptional regulator. By transcriptome sequencing (RNA-seq) of wild-type (wt) and sigma(I)-null strains at 37 degrees C and 52 degrees C, we identified -130 genes affected by the absence of sigma(I). Further analysis revealed that the majority of these genes were affected indirectly by sigma(I). The sigma(I) regulon, i.e., the genes directly regulated by sigma(I), consists of 16 genes, of which eight (the dhb and yku operons) are involved in iron metabolism. The involvement of sigma(I) in iron metabolism was confirmed phenotypically. Next, we set up an in vitro transcription system and defined and experimentally validated the promoter sequence logo that, in addition to -35 and -10 regions, also contains extended -35 and -10 motifs. Thus, sigma(I)-dependent promoters are relatively information rich in comparison with most other promoters. In summary, this study supplies information about the least-explored sigma factor from the industrially important model organism B. subtilis. n

  • Název v anglickém jazyce

    sigma(I) from Bacillus subtilis: Impact on Gene Expression and Characterization of sigma(I)-Dependent Transcription That Requires New Types of Promoters with Extended-35 and-10 Elements

  • Popis výsledku anglicky

    The sigma(I) sigma factor from Bacillus subtilis is a a factor associated with RNA polymerase (RNAP) that was previously implicated in adaptation of the cell to elevated temperature. Here, we provide a comprehensive characterization of this transcriptional regulator. By transcriptome sequencing (RNA-seq) of wild-type (wt) and sigma(I)-null strains at 37 degrees C and 52 degrees C, we identified -130 genes affected by the absence of sigma(I). Further analysis revealed that the majority of these genes were affected indirectly by sigma(I). The sigma(I) regulon, i.e., the genes directly regulated by sigma(I), consists of 16 genes, of which eight (the dhb and yku operons) are involved in iron metabolism. The involvement of sigma(I) in iron metabolism was confirmed phenotypically. Next, we set up an in vitro transcription system and defined and experimentally validated the promoter sequence logo that, in addition to -35 and -10 regions, also contains extended -35 and -10 motifs. Thus, sigma(I)-dependent promoters are relatively information rich in comparison with most other promoters. In summary, this study supplies information about the least-explored sigma factor from the industrially important model organism B. subtilis. n

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Bacteriology

  • ISSN

    0021-9193

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    200

  • Číslo periodika v rámci svazku

    17

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    15

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000441290900010

  • EID výsledku v databázi Scopus