CycloBranch 2.0
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F19%3A00517773" target="_blank" >RIV/61388971:_____/19:00517773 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://ms.biomed.cas.cz/cyclobranch/" target="_blank" >https://ms.biomed.cas.cz/cyclobranch/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
CycloBranch 2.0
Popis výsledku v původním jazyce
CycloBranch 2.0 is an open-source and cross-platform tool for identification of small molecules from mass spectra implemented in C++. A list of new features include: (1) prediction of elemental compositions of unknown compounds in liquid chromatography/mass spectrometry datasets and imaging mass spectra: (2) improved analysis of fragmentation patterns of (non)ribosomal peptides, polyketides and siderophores: (3) analysis of fragmentation patterns of metabolites with non-peptidic structure: (4) processing and visualization of profile mass spectra: (5) analysis of isotopic structures in product ion mass spectra: (6) analysis of fine isotopic structures of compounds containing metals: (7) fusion of mass spectrometry imaging datasets in imzML file format with optical, histology, and microscopy images: (8) visualization of chromatograms: (9) improved support of vendors’ file formats: and (10) many performance improvements, bug fixes, and other minor changes.
Název v anglickém jazyce
CycloBranch 2.0
Popis výsledku anglicky
CycloBranch 2.0 is an open-source and cross-platform tool for identification of small molecules from mass spectra implemented in C++. A list of new features include: (1) prediction of elemental compositions of unknown compounds in liquid chromatography/mass spectrometry datasets and imaging mass spectra: (2) improved analysis of fragmentation patterns of (non)ribosomal peptides, polyketides and siderophores: (3) analysis of fragmentation patterns of metabolites with non-peptidic structure: (4) processing and visualization of profile mass spectra: (5) analysis of isotopic structures in product ion mass spectra: (6) analysis of fine isotopic structures of compounds containing metals: (7) fusion of mass spectrometry imaging datasets in imzML file format with optical, histology, and microscopy images: (8) visualization of chromatograms: (9) improved support of vendors’ file formats: and (10) many performance improvements, bug fixes, and other minor changes.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
—
OECD FORD obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
CycloBranch 2.0
Technické parametry
91 MB
Ekonomické parametry
Automatizace a zvýšení rychlosti zpracování hmotnostních spekter
IČO vlastníka výsledku
61388971
Název vlastníka
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.