Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

CycloBranch 2.0

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F19%3A00517773" target="_blank" >RIV/61388971:_____/19:00517773 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://ms.biomed.cas.cz/cyclobranch/" target="_blank" >https://ms.biomed.cas.cz/cyclobranch/</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    CycloBranch 2.0

  • Popis výsledku v původním jazyce

    CycloBranch 2.0 is an open-source and cross-platform tool for identification of small molecules from mass spectra implemented in C++. A list of new features include: (1) prediction of elemental compositions of unknown compounds in liquid chromatography/mass spectrometry datasets and imaging mass spectra: (2) improved analysis of fragmentation patterns of (non)ribosomal peptides, polyketides and siderophores: (3) analysis of fragmentation patterns of metabolites with non-peptidic structure: (4) processing and visualization of profile mass spectra: (5) analysis of isotopic structures in product ion mass spectra: (6) analysis of fine isotopic structures of compounds containing metals: (7) fusion of mass spectrometry imaging datasets in imzML file format with optical, histology, and microscopy images: (8) visualization of chromatograms: (9) improved support of vendors’ file formats: and (10) many performance improvements, bug fixes, and other minor changes.

  • Název v anglickém jazyce

    CycloBranch 2.0

  • Popis výsledku anglicky

    CycloBranch 2.0 is an open-source and cross-platform tool for identification of small molecules from mass spectra implemented in C++. A list of new features include: (1) prediction of elemental compositions of unknown compounds in liquid chromatography/mass spectrometry datasets and imaging mass spectra: (2) improved analysis of fragmentation patterns of (non)ribosomal peptides, polyketides and siderophores: (3) analysis of fragmentation patterns of metabolites with non-peptidic structure: (4) processing and visualization of profile mass spectra: (5) analysis of isotopic structures in product ion mass spectra: (6) analysis of fine isotopic structures of compounds containing metals: (7) fusion of mass spectrometry imaging datasets in imzML file format with optical, histology, and microscopy images: (8) visualization of chromatograms: (9) improved support of vendors’ file formats: and (10) many performance improvements, bug fixes, and other minor changes.

Klasifikace

  • Druh

    R - Software

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Interní identifikační kód produktu

    CycloBranch 2.0

  • Technické parametry

    91 MB

  • Ekonomické parametry

    Automatizace a zvýšení rychlosti zpracování hmotnostních spekter

  • IČO vlastníka výsledku

    61388971

  • Název vlastníka

    Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.