Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Feeding on fungi: genomic and proteomic analysis of the enzymatic machinery of bacteria decomposing fungal biomass

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F20%3A00535741" target="_blank" >RIV/61388971:_____/20:00535741 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.15183" target="_blank" >https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.15183</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.15183" target="_blank" >10.1111/1462-2920.15183</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Feeding on fungi: genomic and proteomic analysis of the enzymatic machinery of bacteria decomposing fungal biomass

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Dead fungal biomass is an abundant source of nutrition in both litter and soil of temperate forests largely decomposed by bacteria. Here, we have examined the utilization of dead fungal biomass by the five dominant bacteria isolated from thein situdecomposition of fungal mycelia using a multiOMIC approach. The genomes of the isolates encoded a broad suite of carbohydrate-active enzymes, peptidases and transporters. In the extracellular proteome, onlyEwingella americanaexpressed chitinases while the twoPseudomonasisolates attacked chitin by lytic chitin monooxygenase, deacetylation and deamination.Variovoraxsp. expressed enzymes acting on the side-chains of various glucans and the chitin backbone. Surprisingly, despite its genomic potential,Pedobactersp. did not produce extracellular proteins to decompose fungal mycelia but presumably feeds on simple substrates. The ecological roles of the five individual strains exhibited complementary features for a fast and efficient decomposition of dead fungal biomass by the entire bacterial community.

  • Název v anglickém jazyce

    Feeding on fungi: genomic and proteomic analysis of the enzymatic machinery of bacteria decomposing fungal biomass

  • Popis výsledku anglicky

    Dead fungal biomass is an abundant source of nutrition in both litter and soil of temperate forests largely decomposed by bacteria. Here, we have examined the utilization of dead fungal biomass by the five dominant bacteria isolated from thein situdecomposition of fungal mycelia using a multiOMIC approach. The genomes of the isolates encoded a broad suite of carbohydrate-active enzymes, peptidases and transporters. In the extracellular proteome, onlyEwingella americanaexpressed chitinases while the twoPseudomonasisolates attacked chitin by lytic chitin monooxygenase, deacetylation and deamination.Variovoraxsp. expressed enzymes acting on the side-chains of various glucans and the chitin backbone. Surprisingly, despite its genomic potential,Pedobactersp. did not produce extracellular proteins to decompose fungal mycelia but presumably feeds on simple substrates. The ecological roles of the five individual strains exhibited complementary features for a fast and efficient decomposition of dead fungal biomass by the entire bacterial community.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10606 - Microbiology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Environmental Microbiology

  • ISSN

    1462-2912

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    22

  • Číslo periodika v rámci svazku

    11

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    16

  • Strana od-do

    4604-4619

  • Kód UT WoS článku

    000564015400001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85089996565