Feeding on fungi: genomic and proteomic analysis of the enzymatic machinery of bacteria decomposing fungal biomass
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388971%3A_____%2F20%3A00535741" target="_blank" >RIV/61388971:_____/20:00535741 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.15183" target="_blank" >https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.15183</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.15183" target="_blank" >10.1111/1462-2920.15183</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Feeding on fungi: genomic and proteomic analysis of the enzymatic machinery of bacteria decomposing fungal biomass
Popis výsledku v původním jazyce
Dead fungal biomass is an abundant source of nutrition in both litter and soil of temperate forests largely decomposed by bacteria. Here, we have examined the utilization of dead fungal biomass by the five dominant bacteria isolated from thein situdecomposition of fungal mycelia using a multiOMIC approach. The genomes of the isolates encoded a broad suite of carbohydrate-active enzymes, peptidases and transporters. In the extracellular proteome, onlyEwingella americanaexpressed chitinases while the twoPseudomonasisolates attacked chitin by lytic chitin monooxygenase, deacetylation and deamination.Variovoraxsp. expressed enzymes acting on the side-chains of various glucans and the chitin backbone. Surprisingly, despite its genomic potential,Pedobactersp. did not produce extracellular proteins to decompose fungal mycelia but presumably feeds on simple substrates. The ecological roles of the five individual strains exhibited complementary features for a fast and efficient decomposition of dead fungal biomass by the entire bacterial community.
Název v anglickém jazyce
Feeding on fungi: genomic and proteomic analysis of the enzymatic machinery of bacteria decomposing fungal biomass
Popis výsledku anglicky
Dead fungal biomass is an abundant source of nutrition in both litter and soil of temperate forests largely decomposed by bacteria. Here, we have examined the utilization of dead fungal biomass by the five dominant bacteria isolated from thein situdecomposition of fungal mycelia using a multiOMIC approach. The genomes of the isolates encoded a broad suite of carbohydrate-active enzymes, peptidases and transporters. In the extracellular proteome, onlyEwingella americanaexpressed chitinases while the twoPseudomonasisolates attacked chitin by lytic chitin monooxygenase, deacetylation and deamination.Variovoraxsp. expressed enzymes acting on the side-chains of various glucans and the chitin backbone. Surprisingly, despite its genomic potential,Pedobactersp. did not produce extracellular proteins to decompose fungal mycelia but presumably feeds on simple substrates. The ecological roles of the five individual strains exhibited complementary features for a fast and efficient decomposition of dead fungal biomass by the entire bacterial community.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10606 - Microbiology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Environmental Microbiology
ISSN
1462-2912
e-ISSN
—
Svazek periodika
22
Číslo periodika v rámci svazku
11
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
16
Strana od-do
4604-4619
Kód UT WoS článku
000564015400001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85089996565