První náhled do genomu žita (Secale cereale) pomocí sekvenování konců BAC klonů z krátkého ramene chromozómu 1R

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F08%3A00323090" target="_blank" >RIV/61389030:_____/08:00323090 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

A first survey of the rye (Secale cereale) genome composition through BAC end sequencing of the short arm of chromosome 1R

Popis výsledku v původním jazyce

Background: Rye (Secale cereale L.) belongs to tribe Triticeae and is an important temperate cereal. It is one of the parents of man-made species Triticale and has been used as a source of agronomically important genes for wheat improvement. The short arm of rye chromosome 1 (1RS), in particular is rich in useful genes, and as it may increase yield, protein content and resistance to biotic and abiotic stress, it has been introgressed into wheat as the 1BL.1RS translocation. A better knowledge of the ryegenome could facilitate rye improvement and increase the efficiency of utilizing rye genes in wheat breeding. Results: Here, we report on BAC end sequencing of 1,536 clones from two 1RS-specific BAC libraries. We obtained 2,778 (90.4%) useful sequenceswith a cumulative length of 2,032,538 bp and an average read length of 732 bp. These sequences represent 0.5% of 1RS arm. The GC content of the sequenced fraction of 1RS is 45.9%, and at least 84% of the 1RS arm consists of repetitive DNA

Název v anglickém jazyce

A first survey of the rye (Secale cereale) genome composition through BAC end sequencing of the short arm of chromosome 1R

Popis výsledku anglicky

Background: Rye (Secale cereale L.) belongs to tribe Triticeae and is an important temperate cereal. It is one of the parents of man-made species Triticale and has been used as a source of agronomically important genes for wheat improvement. The short arm of rye chromosome 1 (1RS), in particular is rich in useful genes, and as it may increase yield, protein content and resistance to biotic and abiotic stress, it has been introgressed into wheat as the 1BL.1RS translocation. A better knowledge of the ryegenome could facilitate rye improvement and increase the efficiency of utilizing rye genes in wheat breeding. Results: Here, we report on BAC end sequencing of 1,536 clones from two 1RS-specific BAC libraries. We obtained 2,778 (90.4%) useful sequenceswith a cumulative length of 2,032,538 bp and an average read length of 732 bp. These sequences represent 0.5% of 1RS arm. The GC content of the sequenced fraction of 1RS is 45.9%, and at least 84% of the 1RS arm consists of repetitive DNA

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

BMC Plant Biology

ISSN

1471-2229

e-ISSN

—

Svazek periodika

8

Číslo periodika v rámci svazku

95

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000259916300001

EID výsledku v databázi Scopus

—