Reticulate Evolution of the Rye Genome
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F13%3A00423097" target="_blank" >RIV/61389030:_____/13:00423097 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1105/tpc.113.114553" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1105/tpc.113.114553</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1105/tpc.113.114553" target="_blank" >10.1105/tpc.113.114553</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Reticulate Evolution of the Rye Genome
Popis výsledku v původním jazyce
Rye (Secale cereale) is closely related to wheat (Triticum aestivum) and barley (Hordeum vulgare). Due to its large genome (similar to 8 Gb) and its regional importance, genome analysis of rye has lagged behind other cereals. Here, we established a virtual linear gene order model (genome zipper) comprising 22,426 or 72% of the detected set of 31,008 rye genes. This was achieved by high-throughput transcript mapping, chromosome survey sequencing, and integration of conserved synteny information of threesequenced model grass genomes (Brachypodium distachyon, rice [Oryza sativa], and sorghum [Sorghum bicolor]). This enabled a genome-wide high-density comparative analysis of rye/barley/model grass genome synteny. Seventeen conserved syntenic linkage blocks making up the rye and barley genomes were defined in comparison to model grass genomes. Six major translocations shaped the modern rye genome in comparison to a putative Triticeae ancestral genome. Strikingly dissimilar conserved synten
Název v anglickém jazyce
Reticulate Evolution of the Rye Genome
Popis výsledku anglicky
Rye (Secale cereale) is closely related to wheat (Triticum aestivum) and barley (Hordeum vulgare). Due to its large genome (similar to 8 Gb) and its regional importance, genome analysis of rye has lagged behind other cereals. Here, we established a virtual linear gene order model (genome zipper) comprising 22,426 or 72% of the detected set of 31,008 rye genes. This was achieved by high-throughput transcript mapping, chromosome survey sequencing, and integration of conserved synteny information of threesequenced model grass genomes (Brachypodium distachyon, rice [Oryza sativa], and sorghum [Sorghum bicolor]). This enabled a genome-wide high-density comparative analysis of rye/barley/model grass genome synteny. Seventeen conserved syntenic linkage blocks making up the rye and barley genomes were defined in comparison to model grass genomes. Six major translocations shaped the modern rye genome in comparison to a putative Triticeae ancestral genome. Strikingly dissimilar conserved synten
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GBP501%2F12%2FG090" target="_blank" >GBP501/12/G090: Evoluce a funkce komplexních genomů rostlin</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plant Cell
ISSN
1040-4651
e-ISSN
—
Svazek periodika
25
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
3685-3698
Kód UT WoS článku
000327723100008
EID výsledku v databázi Scopus
—