Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Repetitive DNA: A Versatile Tool for Karyotyping in Festuca pratensis Huds

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F17%3A00476564" target="_blank" >RIV/61389030:_____/17:00476564 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1159/000462915" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1159/000462915</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1159/000462915" target="_blank" >10.1159/000462915</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Repetitive DNA: A Versatile Tool for Karyotyping in Festuca pratensis Huds

  • Popis výsledku v původním jazyce

    FISH is a useful method to identify individual chromosomes in a karyotype and to discover their structural changes accompanying genome evolution and speciation. DNA probes for FISH should be chromosome specific and/or exhibit specific patterns of distribution along each chromosome. Such probes are not available in many plants including meadow fescue (Festuca pratensis Huds.), an important forage grass species. In the present study, various DNA repeats identified in Illumina shotgun sequences specific to chromosome 4F of F. pratensis were used as probes for FISH to develop the molecular karyotype of meadow fescue and to reveal a long-range molecular organization of its chromosomes. Five tandem repeats produced specific patterns on individual chromosomes. Their use in combination with probes for rRNA genes enabled the establishment of the molecular karyotype of meadow fescue. Most of the mobile genetic elements were dispersed along all the chromosomes except for the DNA transposon CACTA, which was localized preferentially to telomeric and subtelomeric regions, and a putative LTR element, which was localized to (peri)centromeric regions. Cytogenetic mapping of the 5 tandem repeats in other accessions of meadow fescue showed a highly similar distribution and confirmed the versatility and robustness of these probes.

  • Název v anglickém jazyce

    Repetitive DNA: A Versatile Tool for Karyotyping in Festuca pratensis Huds

  • Popis výsledku anglicky

    FISH is a useful method to identify individual chromosomes in a karyotype and to discover their structural changes accompanying genome evolution and speciation. DNA probes for FISH should be chromosome specific and/or exhibit specific patterns of distribution along each chromosome. Such probes are not available in many plants including meadow fescue (Festuca pratensis Huds.), an important forage grass species. In the present study, various DNA repeats identified in Illumina shotgun sequences specific to chromosome 4F of F. pratensis were used as probes for FISH to develop the molecular karyotype of meadow fescue and to reveal a long-range molecular organization of its chromosomes. Five tandem repeats produced specific patterns on individual chromosomes. Their use in combination with probes for rRNA genes enabled the establishment of the molecular karyotype of meadow fescue. Most of the mobile genetic elements were dispersed along all the chromosomes except for the DNA transposon CACTA, which was localized preferentially to telomeric and subtelomeric regions, and a putative LTR element, which was localized to (peri)centromeric regions. Cytogenetic mapping of the 5 tandem repeats in other accessions of meadow fescue showed a highly similar distribution and confirmed the versatility and robustness of these probes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10611 - Plant sciences, botany

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LO1204" target="_blank" >LO1204: Udržitelný rozvoj výzkumu v Centru regionu Haná</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Cytogenetic and Genome Research

  • ISSN

    1424-8581

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    151

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    96-105

  • Kód UT WoS článku

    000404007600005

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85016641443