Development of oligonucleotide probes for FISH karyotyping in Haynaldia villosa, a wild relative of common wheat
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61389030%3A_____%2F20%3A00532642" target="_blank" >RIV/61389030:_____/20:00532642 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://doi.org/10.1016/j.cj.2020.02.008" target="_blank" >http://doi.org/10.1016/j.cj.2020.02.008</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.cj.2020.02.008" target="_blank" >10.1016/j.cj.2020.02.008</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Development of oligonucleotide probes for FISH karyotyping in Haynaldia villosa, a wild relative of common wheat
Popis výsledku v původním jazyce
Haynaldia villosa is a wild relative of wheat and a valuable gene resource for wheat improvement. Owing to the limited number of probes available for fluorescence in situ hybridization (FISH), the resolution at which the karyotype of H. villosa can be characterized is poor, hampering accurate characterization of small segmental alien introgressions. We designed ten oligonucleotide probes using tandem repeats in DNA sequences derived from the short arm of H. villosa chromosome 6V (6VS). FISH with seven of them resulted in clear signals on H. villosa chromosomes. Using these, we constructed FISH karyotypes for H. villosa using oligo-6VS-1 and oligo-6VS-35 oligonucleotides and characterized the distribution of the two probes in five different H. villosa accessions. The new FISH probes can efficiently characterize H. villosa introgressions into wheat.
Název v anglickém jazyce
Development of oligonucleotide probes for FISH karyotyping in Haynaldia villosa, a wild relative of common wheat
Popis výsledku anglicky
Haynaldia villosa is a wild relative of wheat and a valuable gene resource for wheat improvement. Owing to the limited number of probes available for fluorescence in situ hybridization (FISH), the resolution at which the karyotype of H. villosa can be characterized is poor, hampering accurate characterization of small segmental alien introgressions. We designed ten oligonucleotide probes using tandem repeats in DNA sequences derived from the short arm of H. villosa chromosome 6V (6VS). FISH with seven of them resulted in clear signals on H. villosa chromosomes. Using these, we constructed FISH karyotypes for H. villosa using oligo-6VS-1 and oligo-6VS-35 oligonucleotides and characterized the distribution of the two probes in five different H. villosa accessions. The new FISH probes can efficiently characterize H. villosa introgressions into wheat.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/EF16_019%2F0000827" target="_blank" >EF16_019/0000827: Rostliny jako prostředek udržitelného globálního rozvoje</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Crop Journal
ISSN
2095-5421
e-ISSN
—
Svazek periodika
8
Číslo periodika v rámci svazku
4
Stát vydavatele periodika
CN - Čínská lidová republika
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
676-681
Kód UT WoS článku
000556540200016
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85085209768