Trypanosoma cruzi strain and starvation-driven mitochondrial RNA editing and transcriptome variability
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61988987%3A17310%2F22%3AN2302GR4" target="_blank" >RIV/61988987:17310/22:N2302GR4 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61988987:17310/22:A2302GR4
Výsledek na webu
<a href="https://rnajournal.cshlp.org/content/28/7/993" target="_blank" >https://rnajournal.cshlp.org/content/28/7/993</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1261/rna.079088.121" target="_blank" >10.1261/rna.079088.121</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Trypanosoma cruzi strain and starvation-driven mitochondrial RNA editing and transcriptome variability
Popis výsledku v původním jazyce
Trypanosoma cruzi is a unicellular protistan parasitic species that is comprised of strains and isolates exhibiting high levels of genetic and metabolic variability. In the insect vector, it is known to be highly responsive to starvation, a signal for progression to a life stage in which it can infect mammalian cells. Most mRNAs encoded in its mitochondrion require the targeted insertion and deletion of uridines to become translatable transcripts. This study defined differences in uridine-insertion/deletion RNA editing among three strains and established the mechanism whereby abundances of edited (and, thus, translatable) mitochondrial gene products increase during starvation. Our approach utilized our custom T-Aligner toolkit to describe transcriptome-wide editing events and reconstruct editing products from high-throughput sequencing data.
Název v anglickém jazyce
Trypanosoma cruzi strain and starvation-driven mitochondrial RNA editing and transcriptome variability
Popis výsledku anglicky
Trypanosoma cruzi is a unicellular protistan parasitic species that is comprised of strains and isolates exhibiting high levels of genetic and metabolic variability. In the insect vector, it is known to be highly responsive to starvation, a signal for progression to a life stage in which it can infect mammalian cells. Most mRNAs encoded in its mitochondrion require the targeted insertion and deletion of uridines to become translatable transcripts. This study defined differences in uridine-insertion/deletion RNA editing among three strains and established the mechanism whereby abundances of edited (and, thus, translatable) mitochondrial gene products increase during starvation. Our approach utilized our custom T-Aligner toolkit to describe transcriptome-wide editing events and reconstruct editing products from high-throughput sequencing data.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2022
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
RNA
ISSN
1355-8382
e-ISSN
1469-9001
Svazek periodika
—
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
19
Strana od-do
993-1012
Kód UT WoS článku
000812825700006
EID výsledku v databázi Scopus
—