Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Trypanosoma cruzi strain and starvation-driven mitochondrial RNA editing and transcriptome variability

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61988987%3A17310%2F22%3AN2302GR4" target="_blank" >RIV/61988987:17310/22:N2302GR4 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61988987:17310/22:A2302GR4

  • Výsledek na webu

    <a href="https://rnajournal.cshlp.org/content/28/7/993" target="_blank" >https://rnajournal.cshlp.org/content/28/7/993</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1261/rna.079088.121" target="_blank" >10.1261/rna.079088.121</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Trypanosoma cruzi strain and starvation-driven mitochondrial RNA editing and transcriptome variability

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Trypanosoma cruzi is a unicellular protistan parasitic species that is comprised of strains and isolates exhibiting high levels of genetic and metabolic variability. In the insect vector, it is known to be highly responsive to starvation, a signal for progression to a life stage in which it can infect mammalian cells. Most mRNAs encoded in its mitochondrion require the targeted insertion and deletion of uridines to become translatable transcripts. This study defined differences in uridine-insertion/deletion RNA editing among three strains and established the mechanism whereby abundances of edited (and, thus, translatable) mitochondrial gene products increase during starvation. Our approach utilized our custom T-Aligner toolkit to describe transcriptome-wide editing events and reconstruct editing products from high-throughput sequencing data.

  • Název v anglickém jazyce

    Trypanosoma cruzi strain and starvation-driven mitochondrial RNA editing and transcriptome variability

  • Popis výsledku anglicky

    Trypanosoma cruzi is a unicellular protistan parasitic species that is comprised of strains and isolates exhibiting high levels of genetic and metabolic variability. In the insect vector, it is known to be highly responsive to starvation, a signal for progression to a life stage in which it can infect mammalian cells. Most mRNAs encoded in its mitochondrion require the targeted insertion and deletion of uridines to become translatable transcripts. This study defined differences in uridine-insertion/deletion RNA editing among three strains and established the mechanism whereby abundances of edited (and, thus, translatable) mitochondrial gene products increase during starvation. Our approach utilized our custom T-Aligner toolkit to describe transcriptome-wide editing events and reconstruct editing products from high-throughput sequencing data.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    RNA

  • ISSN

    1355-8382

  • e-ISSN

    1469-9001

  • Svazek periodika

  • Číslo periodika v rámci svazku

    7

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    19

  • Strana od-do

    993-1012

  • Kód UT WoS článku

    000812825700006

  • EID výsledku v databázi Scopus