OLGEN Coverage Limit kalkulátor
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989100%3A27240%2F19%3A10242998" target="_blank" >RIV/61989100:27240/19:10242998 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61989592:15110/19:73598448
Výsledek na webu
<a href="http://app.olgen.cz/clc/" target="_blank" >http://app.olgen.cz/clc/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
OLGEN Coverage Limit kalkulátor
Popis výsledku v původním jazyce
Software umožňuje spočítat potřebné pokrytí osekvenovaného úseku DNA k detekci somatických mutací v lidském genomu. V software je implementován nově navržený pravděpodobností model, který pro danou n-procentní somatickou mutaci a definovanou chybovost měření, spočítá potřebné pokrytí sekvencemi.
Název v anglickém jazyce
OLGEN Coverage Limit calculator
Popis výsledku anglicky
The software allows to calculate the required coverage depth of the sequenced DNA segment to detect somatic mutations in the human genome. The software implements a newly designed probability model that calculates the required sequence coverage depth for a given n-percent somatic mutation and a defined error rate of measurement.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
—
OECD FORD obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/NV16-32339A" target="_blank" >NV16-32339A: Vliv funkčních polymorfismů ovlivňujících zánět a oxidační stres na průběh chronické lymfocytární leukémie a volbu individuální léčebné strategie</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
014/25-11-2019_SW
Technické parametry
Software je implementován v jazyce Python pro platformu Windows. Software lze nainstalovat pomocí všeobsahujícího instalačního souboru nebo využít webovou aplikaci.
Ekonomické parametry
Tento software reaguje na potřebu stanovení minimálního potřebného pokrytí vybraného úseku genomu při sekvenování lidské DNA, které by zajistilo odlišení nesprávně detekovaných somatických mutací od skutečných mutací v rámci předdefinovaných parametrů. Použití software snižuje riziko potřeby opětovného, nákladného sekvenování zkoumaného genomu.
IČO vlastníka výsledku
61989100
Název vlastníka
Vysoká škola báňská - Technická univerzita, Fakulta elektrotechniky a informatiky, Katedra informatiky