AggreProt 1.0
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989100%3A27740%2F24%3A10256878" target="_blank" >RIV/61989100:27740/24:10256878 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00159816:_____/24:00081653
Výsledek na webu
<a href="https://loschmidt.chemi.muni.cz/aggreprot/" target="_blank" >https://loschmidt.chemi.muni.cz/aggreprot/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
AggreProt 1.0
Popis výsledku v původním jazyce
AggreProt je webový server pro predikci a inženýrství agregace proteinů. Využívá hluboké konvoluční neuronové sítě k vyhodnocování náchylnosti hexapeptidů k agregaci na základě jejich geometrických vlastností. Předpovědi pro různé hexapeptidy se kombinují a poskytují hodnoty agregace na jedno reziduum a celkový profil hustoty. Tyto informace jsou dány do kontextu s přístupností rozpouštědla a transmembránovou náchylností, což uživatelům pomáhá identifikovat povrchově exponované oblasti náchylné k agregaci oproti hydrofobním jádrům.
Název v anglickém jazyce
AggreProt 1.0
Popis výsledku anglicky
AggreProt is a web server for predicting and engineering protein aggregation. It uses deep convolutional neural networks to assess the aggregation propensity of hexapeptides based on their geometrical features. The predictions for different hexapeptides are combined to provide per-residue aggregation values and an overall density profile. This information is contextualised with solvent accessibility and transmembrane propensity to help users identify surface-exposed aggregation-prone regions versus hydrophobic cores.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
—
OECD FORD obor
10200 - Computer and information sciences
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2024
Kód důvěrnosti údajů
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
002/30-01-2025_SW
Technické parametry
Doposud je využíváno interně oběma subjekty k výzkumným účelům
Ekonomické parametry
V budoucnu je plánována nabídka potencionálním partnerům z komerční sfér
IČO vlastníka výsledku
61989100
Název vlastníka
Vysoká škola báňská - Technická univerzita Ostrava