Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Performance of optimized McRAPD in identification of 9 yeast species frequently isolated from patient samples: potential for automation

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F09%3A00009795" target="_blank" >RIV/61989592:15110/09:00009795 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Performance of optimized McRAPD in identification of 9 yeast species frequently isolated from patient samples: potential for automation

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Background. Rapid, easy, economical and accurate species identification of yeasts isolated from clinical samples remains an important challenge for routine microbiological laboratories, because susceptibility to antifungal agents, probability to developresistance and ability to cause disease vary in different species. To overcome the drawbacks of the currently available techniques we have recently proposed an innovative approach to yeast species identification based on RAPD genotyping and termed McRAPD(Melting curve of RAPD). Here we have evaluated its performance on a broader spectrum of clinically relevant yeast species and also examined the potential of automated and semi-automated interpretation of McRAPD data for yeast species identification. Results. A simple fully automated algorithm based on normalized melting data identified 80% of the isolates correctly. When this algorithm was supplemented by semi-automated matching of decisive peaks in first derivative plots, 87% of the i

  • Název v anglickém jazyce

    Performance of optimized McRAPD in identification of 9 yeast species frequently isolated from patient samples: potential for automation

  • Popis výsledku anglicky

    Background. Rapid, easy, economical and accurate species identification of yeasts isolated from clinical samples remains an important challenge for routine microbiological laboratories, because susceptibility to antifungal agents, probability to developresistance and ability to cause disease vary in different species. To overcome the drawbacks of the currently available techniques we have recently proposed an innovative approach to yeast species identification based on RAPD genotyping and termed McRAPD(Melting curve of RAPD). Here we have evaluated its performance on a broader spectrum of clinically relevant yeast species and also examined the potential of automated and semi-automated interpretation of McRAPD data for yeast species identification. Results. A simple fully automated algorithm based on normalized melting data identified 80% of the isolates correctly. When this algorithm was supplemented by semi-automated matching of decisive peaks in first derivative plots, 87% of the i

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EE - Mikrobiologie, virologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/NR8365" target="_blank" >NR8365: Druhová identifikace patogenních kvasinek založená na analýze teploty tání produktů fingerprintingu</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2009

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    BMC Microbiology

  • ISSN

    1471-2180

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    234

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    21

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus