Porovnání hmotnostně spektrometrických přístupů v proteomickém profilování léčiv
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F16%3A33162906" target="_blank" >RIV/61989592:15110/16:33162906 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Porovnání hmotnostně spektrometrických přístupů v proteomickém profilování léčiv
Popis výsledku v původním jazyce
Při analýze proteomu se využívají dva hlavní iontové zdroje, elektrosprej (ESI) a matricí asistovaná laserová desorpce/ionizace (MALDI). Pro účely jejich porovnání byla SILAC značená linie CCRF-CEM ošetřená třemi platinovými léčivy a následně byl po frakcionaci a digesci analyzován celobuněčný proteinový lyzát. Vzorky byly paralelně měřeny na třech hmotnostních spektrometrech s různými analyzátory - iontovou pastí (ESI-IT), analyzátorem doby letu (MALDI-TOF) a orbitální iontovou pastí (nESI-Orbitrap). Každý spektrometr byl spojen s vysokoúčinnou kapalinovou chromatografií a byl nezávisle optimalizován pro nejvyšší výkon.
Název v anglickém jazyce
THE COMPARISON OF MASS SPECTROMETRY APPROACHES IN PROTEOMIC PROFILING OF DRUG RESPONSES
Popis výsledku anglicky
There are two main mass spectrometry approaches in proteome analysis: electrospray (ESI) and matrix assisted laser desorption/ionization (MALDI). For purposes of their comparison, the SILAC labeled CCRF-CEM cell line was treated by three platinum drugs and whole cell lysate was analyzed. Samples were measured in parallel by three mass spectrometers - ion trap (ESI- -IT), time-of flight (MALDI-TOF) and orbital ion trap (nESI-Orbitrap). Each spectrometer was coupled with high performance liquid chromatography and independently optimized for best performance.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/LO1304" target="_blank" >LO1304: Podpora udržitelnosti Ústavu molekulární a translační medicíny</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Chemagazín
ISSN
1210-7409
e-ISSN
—
Svazek periodika
2016
Číslo periodika v rámci svazku
5
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
8-11
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—